Effects of a Guanine-derived Formamidopyrimidine Lesion on DNA Replication
Effects of a Guanine-derived Formamidopyrimidine Lesion on DNA Replication
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鸟嘌呤衍生的甲酰胺嘧啶损伤对 DNA 复制的影响
DOI：
--
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发表时间：
2002
影响因子：
4.8
通讯作者：
H. Ide
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
K. Asagoshi;H. Terato;Y. Ohyama;H. Ide
鸟嘌呤衍生的2，6-二氨基-4-羟基-5-甲酰胺基嘧啶（FapyG）是由活性氧形成的主要DNA损伤。在这项研究中，一个定义的寡核苷酸模板含有5-N-甲基化类似物的FapyG（mFapyG）的制备，并在体外定量评估其对DNA复制的影响。结果进一步与7，8-二氢-8-氧代鸟嘌呤和无嘌呤/无嘧啶位点嵌入在相同的序列背景下获得的结果进行了比较。mFapyG对大肠杆菌DNA聚合酶I Klenow片段催化的DNA合成具有相当强的但不是绝对的阻断作用，其具有或不具有相关的3′-5′核酸外切酶活性，从而允许有限效率的跨损伤合成。跨损伤合成效率为G > 7，8-二氢-8-氧代鸟嘌呤> mFapyG >脱嘌呤/脱嘧啶位点。对mFapyG的核苷酸插入效率（f ins =V max/Km用于插入）和延伸效率（f ext =V max/Km用于延伸）的分析表明，延伸步骤构成了DNA合成的主要动力学屏障。当绕过mFapyG时，同源核苷酸dCMP优先插入病变的对面（dCMP（相对f ins = 1）→ dTMP（2.4 × 10−4）→ dAMP（8.1 × 10−5）> dGMP（4.5 × 10−7）），含有mFapyG：C对的引物末端最有效地延伸（mFapyG：C（相对f ext = 1）> mFapyG：T（4.6 × 10−3）→ mFapyG：A和mFapyG：G（未观察到延伸））。因此，mFapyG是一种潜在的致死性病变，但不是致突变前病变。
2,6-Diamino-4-hydroxy-5-formamidopyrimidine derived from guanine (FapyG) is a major DNA lesion formed by reactive oxygen species. In this study, a defined oligonucleotide template containing a 5-N-methylated analog of FapyG (mFapyG) was prepared, and its effect on DNA replication was quantitatively assessed in vitro. The results were further compared with those obtained for 7,8-dihydro-8-oxoguanine and an apurinic/apyrimidinic site embedded in the same sequence context. mFapyG constituted a fairly strong but not absolute block to DNA synthesis catalyzed by Escherichia coli DNA polymerase I Klenow fragment with and without an associated 3′-5′ exonuclease activity, thereby permitting translesion synthesis with a limited efficiency. The efficiency of translesion synthesis was G > 7,8-dihydro-8-oxoguanine > mFapyG > apurinic/apyrimidinic site. Analysis of the nucleotide insertion (f ins =V max/K m for insertion) and extension (f ext =V max/K m for extension) efficiencies for mFapyG revealed that the extension step constituted a major kinetic barrier to DNA synthesis. When mFapyG was bypassed, dCMP, a cognate nucleotide, was preferentially inserted opposite the lesion (dCMP (relative f ins = 1) ≫ dTMP (2.4 × 10−4) ≈ dAMP (8.1 × 10−5) > dGMP (4.5 × 10−7)), and the primer terminus containing a mFapyG:C pair was most efficiently extended (mFapyG:C (relative f ext = 1) > mFapyG:T (4.6 × 10−3) ≫ mFapyG:A and mFapyG:G (extension not observed)). Thus, mFapyG is a potentially lethal but not premutagenic lesion.
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体外 DNA 合成过程中化学诱变剂诱导的碱基取代和缺失的定量。
影响因子：
4.1
作者：
Shibutani,S
通讯作者：
Shibutani,S
影响因子：
56.9
作者：
AMES, BN
通讯作者：
AMES, BN
DOI：
10.1073/pnas.90.3.1122
发表时间：
1993-02-01
影响因子：
11.1
作者：
MORIYA, M
通讯作者：
MORIYA, M
使用 HIV-1 逆转录酶在不同序列环境中脱氧核糖核苷酸在无碱基模板损伤处插入和延伸的动力学。
DOI：
--
发表时间：
1993
期刊：
The Journal of biological chemistry
影响因子：
--
作者：
Cai,H;Bloom,LB;Eritja,R;Goodman,MF
通讯作者：
Goodman,MF
DOI：
10.1016/s0021-9258(18)48324-x
发表时间：
1987-05
期刊：
The Journal of biological chemistry
影响因子：
--
作者：
S. Randall;Ramon Eritjaj;Bruce E. Kaplanj;John PetruskaS;M. Goodman
通讯作者：
S. Randall;Ramon Eritjaj;Bruce E. Kaplanj;John PetruskaS;M. Goodman