The design of mapping populations: Impacts of geographic scale on genetic architecture and mapping efficacy for defense and immunity.
The design of mapping populations: Impacts of geographic scale on genetic architecture and mapping efficacy for defense and immunity.
复制标题
DOI：
10.1016/j.pbi.2023.102399
复制
发表时间：
2023-08
影响因子：
9.5
通讯作者：
Bergelson, Joy
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gloss, Andrew D.;Steiner, Margaret C.;Novembre, John;Bergelson, Joy
全基因组关联研究（GWAS）已经对性状变异的遗传结构产生了巨大的见解。然而，他们发现的基因座集合还远远不够详尽。由于许多混淆或限制GWAS功效的复杂因素在广泛的地理尺度上被夸大了，因此转向使用从狭窄的地理位置（“当地”人口）取样的地图面板进行更多分析可以提供新颖的，互补的见解。在这里，我们概述了主要的复杂因素，回顾了基因组分析中越来越多的证据，这些证据表明这些因素普遍存在，并综合了GWAS在当地人群中的作用的理论和经验证据。
Genome-wide association studies (GWAS) have yielded tremendous insight into the genetic architecture of trait variation. However, the collections of loci they uncover are far from exhaustive. As many of the complicating factors that confound or limit the efficacy of GWAS are exaggerated over broad geographic scales, a shift toward more analyses using mapping panels sampled from narrow geographic localities (“local” populations) could provide novel, complementary insights. Here, we present an overview of the major complicating factors, review mounting evidence from genomic analyses that these factors are pervasive, and synthesize theoretical and empirical evidence for the power of GWAS in local populations.
登录
查看更多内容
影响因子：
4.5
作者：
Liu X;Huang M;Fan B;Buckler ES;Zhang Z
通讯作者：
Zhang Z
影响因子：
30.8
作者：
Danjou F;Zoledziewska M;Sidore C;Steri M;Busonero F;Maschio A;Mulas A;Perseu L;Barella S;Porcu E;Pistis G;Pitzalis M;Pala M;Menzel S;Metrustry S;Spector TD;Leoni L;Angius A;Uda M;Moi P;Thein SL;Galanello R;Abecasis GR;Schlessinger D;Sanna S;Cucca F
通讯作者：
Cucca F
影响因子：
4.9
作者：
Demirjian C;Razavi N;Desaint H;Lonjon F;Genin S;Roux F;Berthomé R;Vailleau F
通讯作者：
Vailleau F
影响因子：
3.7
作者：
Manchia M;Cullis J;Turecki G;Rouleau GA;Uher R;Alda M
通讯作者：
Alda M
影响因子：
16.6
作者：
Bettgenhaeuser J;Hernández-Pinzón I;Dawson AM;Gardiner M;Green P;Taylor J;Smoker M;Ferguson JN;Emmrich P;Hubbard A;Bayles R;Waugh R;Steffenson BJ;Wulff BBH;Dreiseitl A;Ward ER;Moscou MJ
通讯作者：
Moscou MJ