The Sol Genomics Network (SGN)--from genotype to phenotype to breeding.
The Sol Genomics Network (SGN)--from genotype to phenotype to breeding.
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DOI：
10.1093/nar/gku1195
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发表时间：
2015-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Mueller LA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fernandez-Pozo N;Menda N;Edwards JD;Saha S;Tecle IY;Strickler SR;Bombarely A;Fisher-York T;Pujar A;Foerster H;Yan A;Mueller LA
SolGenomics Network（SGN，http://solgenomics.net）是一个门户网站，提供基因组和表型数据，以及茄科及其近亲的分析工具。SGN拥有越来越多的茄科家族成员的全基因组数据，包括番茄、马铃薯、辣椒、茄子、烟草和本氏烟草。该数据库还存储了基因座和表型数据，研究人员可以通过用户友好的网络界面上传和编辑这些数据。可使用BLAST、GBrowse和JBrowse等工具浏览基因组、表达和图谱数据查看器、基因座群落注释系统和QTL分析工具。最近实施了一种新的工具来改善病毒诱导的基因沉默（VIGS）构建体，称为SGN VIGS工具。随着数据库中越来越多的基因组和表型数据，SGN现在正在开发新的基于网络的育种工具，并为其他物种或分支特定的数据库实施代码和数据库结构。
The Sol Genomics Network (SGN, http://solgenomics.net) is a web portal with genomic and phenotypic data, and analysis tools for the Solanaceae family and close relatives. SGN hosts whole genome data for an increasing number of Solanaceae family members including tomato, potato, pepper, eggplant, tobacco and Nicotiana benthamiana. The database also stores loci and phenotype data, which researchers can upload and edit with user-friendly web interfaces. Tools such as BLAST, GBrowse and JBrowse for browsing genomes, expression and map data viewers, a locus community annotation system and a QTL analysis tools are available. A new tool was recently implemented to improve Virus-Induced Gene Silencing (VIGS) constructs called the SGN VIGS tool. With the growing genomic and phenotypic data in the database, SGN is now advancing to develop new web-based breeding tools and implement the code and database structure for other species or clade-specific databases.
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GDR（酒渣鼻科的基因组数据库）：酒渣鼻基因组学和遗传学数据的综合网络数据库。
影响因子：
14.9
作者：
Jung S;Staton M;Lee T;Blenda A;Svancara R;Abbott A;Main D
通讯作者：
Main D
影响因子：
5.4
作者：
Cobb, Joshua N.;DeClerck, Genevieve;Greenberg, Anthony;Clark, Randy;McCouch, Susan
通讯作者：
McCouch, Susan
DOI：
10.1093/database/bat028
发表时间：
2013
期刊：
Database : the journal of biological databases and curation
影响因子：
--
作者：
Pujar A;Menda N;Bombarely A;Edwards JD;Strickler SR;Mueller LA
通讯作者：
Mueller LA
影响因子：
64.8
作者：
Matsumoto, T;Wu, JZ;Sugiura, M
通讯作者：
Sugiura, M
影响因子：
2.3
作者：
Rife, Trevor W.;Poland, Jesse A.
通讯作者：
Poland, Jesse A.