Identification of transcriptional regulators in the mouse immune system.
Identification of transcriptional regulators in the mouse immune system.
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DOI：
10.1038/ni.2587
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发表时间：
2013-06
影响因子：
30.5
通讯作者：
Koller, Daphne
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Jojic, Vladimir;Shay, Tal;Sylvia, Katelyn;Zuk, Or;Sun, Xin;Kang, Joonsoo;Regev, Aviv;Koller, Daphne
造血干细胞向免疫细胞的分化在哺乳动物中已经得到了广泛的研究，但控制它的转录电路仍然只是部分了解。在这里，免疫基因组计划跨小鼠免疫谱系的基因表达谱使我们能够系统地分析这些电路。使用名为Ontogenet的计算算法，我们发现了小鼠造血的分化阶段特异性调节因子，鉴定了许多已知的造血调节因子，以及175种新的候选调节因子、其靶基因以及它们作用的细胞类型。在这些新的调节因子中，我们重点介绍了ETV 5在γδT细胞分化中的作用。由于人类和小鼠细胞的转录程序是高度保守的，因此从小鼠模型中吸取的许多教训可能适用于人类。
The differentiation of hematopoietic stem cells into immune cells has been extensively studied in mammals, but the transcriptional circuitry controlling it is still only partially understood. Here, the Immunological Genome Project gene expression profiles across mouse immune lineages allowed us to systematically analyze these circuits. Using a computational algorithm called Ontogenet, we uncovered differentiation-stage specific regulators of mouse hematopoiesis, identifying many known hematopoietic regulators, and 175 new candidate regulators, their target genes, and the cell types in which they act. Among the novel regulators, we highlight the role of ETV5 in γδT cells differntiation. Since the transcriptional program of human and mouse cells is highly conserved, it is likely that many lessons learned from the mouse model apply to humans.
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影响因子：
4.5
作者：
Lee SI;Dudley AM;Drubin D;Silver PA;Krogan NJ;Pe'er D;Koller D
通讯作者：
Koller D
DOI：
10.1126/science.1162327
发表时间：
2009-06-26
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Badis G;Berger MF;Philippakis AA;Talukder S;Gehrke AR;Jaeger SA;Chan ET;Metzler G;Vedenko A;Chen X;Kuznetsov H;Wang CF;Coburn D;Newburger DE;Morris Q;Hughes TR;Bulyk ML
通讯作者：
Bulyk ML
DOI：
10.1126/science.1198704
发表时间：
2011-05-06
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Bendall SC;Simonds EF;Qiu P;Amir el-AD;Krutzik PO;Finck R;Bruggner RV;Melamed R;Trejo A;Ornatsky OI;Balderas RS;Plevritis SK;Sachs K;Pe'er D;Tanner SD;Nolan GP
通讯作者：
Nolan GP
DOI：
10.1073/pnas.1222738110
发表时间：
2013-02-19
影响因子：
11.1
作者：
Shay, Tal;Jojic, Vladimir;Regev, Aviv
通讯作者：
Regev, Aviv
影响因子：
5.4
作者：
Bodor, Josef;Fehervari, Zoltan;Sakaguchi, Shimon
通讯作者：
Sakaguchi, Shimon