Antigenic characteristics and genomic analysis of novel EV-A90 enteroviruses isolated in Xinjiang, China.
Antigenic characteristics and genomic analysis of novel EV-A90 enteroviruses isolated in Xinjiang, China.
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新疆分离的新型EV-A90肠道病毒的抗原特征及基因组分析
DOI：
10.1038/s41598-018-28469-9
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发表时间：
2018-07-06
影响因子：
4.6
通讯作者：
Xu W
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Huang K;Zhang Y;Song Y;Cui H;Yan D;Zhu S;Sun Q;Tang H;Wang D;Xu W
肠道病毒A90（EV-A90）是一种罕见的肠道病毒A型血清型。我们从新疆和田和喀什地区急性弛缓性麻痹患者中分离到5株肠道病毒，经分子分型鉴定为EV-A90。这些新疆EV-A90株的VP 1序列与原型EV-A90株的核苷酸序列同源性为88.4-89%，但基因组分析表明，在P2和P3区发生了复杂的重组事件。在和田和喀什地区共检测了49份血清标本，EV-A90抗体阳性率为37.5%（>1：8），几何平均滴度（GMT）为1：10.47。低阳性率和GMT提示新疆EV-A90处于低水平流行。5株EV-A90新疆分离株中，2株为温度敏感型，3株为温度抗性型，比较基因组学分析表明3Dpol 1区的一个氨基酸替换（H1799 Y）与温度敏感性相关。虽然流行强度较低，但部分EV-A90菌株具有耐温性，表明其毒力和传播能力较强。本研究扩大了EV-A90在GenBank中的收录范围，为EV-A90的分子流行病学研究提供了基础资料。
Enterovirus A90 (EV-A90) is a novel serotype of enterovirus A species that is rarely reported. Here, we isolated five enteroviruses from patients with acute flaccid paralysis in Hotan and Kashgar cities in Xinjiang, China that were identified as EV-A90 by molecular typing. TheVP1sequences of these Xinjiang EV-A90 strains showed 88.4–89% nucleotide sequence identity to the prototype EV-A90 strain; however, genome analysis indicated complex recombination events inP2andP3 regions. Next, the seroprevalence of EV-A90 was examined in 49 serum specimens collected in Hotan and Kashgar, and 37.5% were EV-A90 antibody positive (>1:8), with a geometric mean titre (GMT) of 1:10.47. The low positive rate and GMT suggest a low-level EV-A90 epidemic in Xinjiang. Two of the five Xinjiang EV-A90 strains were temperature sensitive, and three were temperature resistant, and a comparative genomics analysis suggested that an amino acid substitution (H1799Y) in the 3Dpolregion was related to temperature sensitivity. Although the epidemic strength is low, some EV-A90 strains were temperature resistant, which is suggestive of strong virulence and transmission capacity. This study expanded the number of EV-A90 in GenBank and provided basic data that may be useful for studying the molecular epidemiology of EV-A90.
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