Activation and characterization of a cryptic polycyclic tetramate macrolactam biosynthetic gene cluster.
Activation and characterization of a cryptic polycyclic tetramate macrolactam biosynthetic gene cluster.
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DOI：
10.1038/ncomms3894
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发表时间：
2013
影响因子：
16.6
通讯作者：
Zhao, Huimin
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Luo, Yunzi;Huang, Hua;Liang, Jing;Wang, Meng;Lu, Lu;Shao, Zengyi;Cobb, Ryan E.;Zhao, Huimin
多环四酸大环内酯类化合物是一类分布广泛、具有重要生物活性的天然产物。然而，其中许多尚未定性。在这里，我们应用即插即用的合成生物学策略，激活一个隐藏的PTM生物合成基因簇SGR 810 -815从灰色链霉菌，发现三个潜在的PTM。该基因簇在遗传多样的细菌菌株中高度保守，并且包含一种不寻常的杂合聚酮酶-非核糖体肽合成酶（PKS-NRPS），其类似于真菌中已知的迭代PKSs。为了进一步表征该基因簇，我们使用相同的合成生物学方法来创建一系列基因缺失构建体，并阐明形成多环系统的生物合成步骤。我们采用的策略绕过了传统的费力的过程，以引起基因簇的表达，并应普遍适用于许多其他沉默或隐藏的基因簇的发现和表征的新的天然产物。
Polycyclic tetramate macrolactams (PTMs) are a widely distributed class of natural products with important biological activities. However, many of them have not been characterized. Here we apply a plug and play synthetic biology strategy to activate a cryptic PTM biosynthetic gene cluster SGR810-815 from Streptomyces griseus and discover three potential PTMs. This gene cluster is highly conserved in phylogenetically diverse bacterial strains and contains an unusual hybrid polyketide synthase-nonribosomal peptide synthetase (PKS-NRPS) which resembles iterative PKSs known in fungi. To further characterize this gene cluster, we use the same synthetic biology approach to create a series of gene deletion constructs and elucidate the biosynthetic steps for the formation of the polycyclic system. The strategy we employ bypasses the traditional laborious processes to elicit gene cluster expression and should be generally applicable to many other silent or cryptic gene clusters for discovery and characterization of new natural products.
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影响因子：
3.3
作者：
Jakobi, M;Winkelmann, G;Bahl, H
通讯作者：
Bahl, H
影响因子：
3.2
作者：
Ohnishi, Yasuo;Ishikawa, Jun;Horinouchi, Sueharu
通讯作者：
Horinouchi, Sueharu
DOI：
10.1073/pnas.120163297
发表时间：
2000-06-06
影响因子：
11.1
作者：
Datsenko, KA;Wanner, BL
通讯作者：
Wanner, BL
影响因子：
3.3
作者：
JOMON, K;AJISAKA, M;KURODA, Y
通讯作者：
KURODA, Y
影响因子：
14.8
作者：
Bergmann, Sebastian;Schuemann, Julia;Hertweck, Christian
通讯作者：
Hertweck, Christian