Using ontologies to describe mouse phenotypes.

Using ontologies to describe mouse phenotypes.
复制标题

DOI:
10.1186/gb-2004-6-1-r8
复制
发表时间:
2005
期刊:
影响因子:
12.3
通讯作者:
Davidson D
Davidson D
中科院分区:
生物学1区
文献类型:
--
作者:
Gkoutos GV;Green EC;Mallon AM;Hancock JM;Davidson D

文献摘要

参考文献

被引文献

相似文献

通过结合来自不同来源的本体论,作者开发了一种新颖的方法来以标准的结构化方式描述突变小鼠的表型。 小鼠是人类遗传疾病的重要模型。以标准的结构化方式描述突变小鼠的表型,以促进数据挖掘是生物信息学的主要挑战。在这里,我们描述了针对此问题的一种新颖的组成方法,该方法结合了来自各种来源的核心本体。与以前的方法相比,这会产生一个具有更大灵活性,功率和经济性的框架。我们讨论了这种方法提出的一些问题。
By combining ontologies from different sources the authors developed a novel approach to describing phenotypes of mutant mice in a standard, structured manner. The mouse is an important model of human genetic disease. Describing phenotypes of mutant mice in a standard, structured manner that will facilitate data mining is a major challenge for bioinformatics. Here we describe a novel, compositional approach to this problem which combines core ontologies from a variety of sources. This produces a framework with greater flexibility, power and economy than previous approaches. We discuss some of the issues this approach raises.
DOI: 10.1186/gb-2004-6-1-r7
发表时间: 2005
期刊: Genome biology
影响因子: 12.3
作者:
Smith CL;Goldsmith CA;Eppig JT
通讯作者: Eppig JT
DOI: 10.1093/nar/gkh036
发表时间: 2004-01-01
影响因子: 14.9
作者:
Harris, MA;Clark, J;White, R
通讯作者: White, R
DOI: 10.1108/10662240110388224
发表时间: 2001-01-01
期刊: INTERNET RESEARCH
影响因子: 5.9
作者:
Thelwall, M
通讯作者: Thelwall, M
DOI: 10.1093/bioinformatics/19.2.241
发表时间: 2003-01-22
期刊: BIOINFORMATICS
影响因子: 5.8
作者:
Yeh, I;Karp, PD;Altman, RB
通讯作者: Altman, RB
DOI: 10.1093/nar/29.1.98
发表时间: 2001-01-01
影响因子: 14.9
作者:
Ringwald, M;Eppig, JT;Richardson, JE
通讯作者: Richardson, JE