Next-generation sequencing to generate interactome datasets.
Next-generation sequencing to generate interactome datasets.
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DOI：
10.1038/nmeth.1597
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发表时间：
2011-06
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Vidal, Marc
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yu, Haiyuan;Tardivo, Leah;Tam, Stanley;Weiner, Evan;Gebreab, Fana;Fan, Changyu;Svrzikapa, Nenad;Hirozane-Kishikawa, Tomoko;Rietman, Edward;Yang, Xinping;Sahalie, Julie;Salehi-Ashtiani, Kourosh;Hao, Tong;Cusick, Michael E.;Hill, David E.;Roth, Frederick P.;Braun, Pascal;Vidal, Marc
下一代测序（NGS）尚未应用于蛋白质-蛋白质相互作用组网络映射到目前为止，因为每个相互作用对的成员之间的关联将不会在测序中保持。我们描述了一个大规模并行的相互作用组映射管道，“缝合Seq”，结合PCR拼接与NGS。我们使用Stitch-Seq来生成新的人类相互作用组数据集。Stitch-Seq适用于各种相互作用测定，并应有助于扩展相互作用组网络作图。
Next-generation sequencing (NGS) has not been applied to protein-protein interactome network mapping so far because the association between the members of each interacting pair would not be maintained in en masse sequencing. We describe a massively parallel interactome-mapping pipeline, “Stitch-Seq”, that combines PCR stitching with NGS. We use Stitch-Seq to generate a new human interactome dataset. Stitch-Seq is applicable to various interaction assays and should help expand interactome network mapping.
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影响因子：
56.9
作者：
Shendure, J;Porreca, GJ;Church, GM
通讯作者：
Church, GM
影响因子：
56.9
作者：
Walhout, AJM;Sordella, R;Vidal, M
通讯作者：
Vidal, M
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作者：
Lamesch P;Li N;Milstein S;Fan C;Hao T;Szabo G;Hu Z;Venkatesan K;Bethel G;Martin P;Rogers J;Lawlor S;McLaren S;Dricot A;Borick H;Cusick ME;Vandenhaute J;Dunham I;Hill DE;Vidal M
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作者：
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