Complete Mitochondrial Genome of Bubo bubo (Aves, Strigiformes, Strigidae), a National Protected Wildlife Bird in China
Complete Mitochondrial Genome of Bubo bubo (Aves, Strigiformes, Strigidae), a National Protected Wildlife Bird in China
复制标题
中国国家重点保护野生动物大腹鹬（鸟科、鸫形目、鸫科）线粒体全基因组
DOI：
10.3103/s0095452721030087
复制
发表时间：
2021-05
影响因子：
0.5
通讯作者：
Yu-Jie Xu
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhumei Ren;Yu-Jie Xu
我们用鸟枪基因组略读法对布波布波的线粒体基因组进行了全序列测定。B. bubo基因全长18,956 bp，由13个蛋白质编码基因（PCG）、22个tRNA基因、2个rRNA基因和2个非编码控制区（CR）组成，碱基组成为29.6%A、22.5%T、33.8%C和14.1%G。所有的蛋白质编码基因开始与典型的ATG密码子除了ND 3和ND 5，其起始ATA。13个PCG中有7个以密码子TAA终止，其余3个（ND 2、ND 4和COX 3）以单个T终止。ND 1和COX 1以密码子AGG终止，ND 6以密码子TAG终止。基于13个蛋白质编码基因构建的ML系统发育树表明，Bubo种与Strigidae中的Strix属形成了一个单系群。
We sequenced the complete mitochondrial genome (mitogenome) of Bubo bubo by the shotgun genome skimming method. The mitogenome of B. bubo is 18,956 bp in length with a base composition of 29.6% A, 22.5% T, 33.8% C and 14.1% G, and consists of 13 protein-coding genes (PCGs), 22 tRNA genes, two rRNA genes, and two non-coding control regions (CRs). All the protein-coding genes begin with the typical ATG codon except ND3 and ND5, which initiate with ATA. Seven of the 13 PCGs terminate with the codon TAA, and three (ND2, ND4 and COX3) of the remainder end with a single T. Whereas, ND1 and COX1 terminate with a codon AGG and ND6 stops with a codon TAG. The ML phylogenetic trees based on 13 protein-coding genes indicated that Bubo species formed a monophyletic group which was sister to the genus Strix within the same family Strigidae.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1111/ahe.12206
发表时间：
2016-10
期刊：
Anatomia
影响因子：
--
作者：
Y. Akbulut;Y. Demiraslan;K. Aslan;A. Çoban
通讯作者：
Y. Akbulut;Y. Demiraslan;K. Aslan;A. Çoban
影响因子：
4.1
作者：
E. Zimmer;J. Wen
通讯作者：
E. Zimmer;J. Wen
影响因子：
--
作者：
S. Barišić;V. Tutiš;D. Ćiković;Jelena Kralj;Zlatko Ružanović
通讯作者：
S. Barišić;V. Tutiš;D. Ćiković;Jelena Kralj;Zlatko Ružanović
影响因子：
1.7
作者：
Bankevich, Anton;Nurk, Sergey;Pevzner, Pavel A.
通讯作者：
Pevzner, Pavel A.
影响因子：
10.7
作者：
Katoh K;Standley DM
通讯作者：
Standley DM