Antibodies specific for nucleic acid modifications.
Antibodies specific for nucleic acid modifications.
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DOI：
10.1080/15476286.2017.1295905
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发表时间：
2017-09-02
期刊：
影响因子：
4.1
通讯作者：
Schepers A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Feederle R;Schepers A
核苷酸修饰构成 RNA 和 DNA 中的标记，有助于基因调控、发育和其他细胞过程。由于大量不同的修饰、缺乏有效的检测和定量方法和工具以及复杂的结构-功能关系，人们对其复杂的分子作用的理解受到阻碍。最近 RNA 和 DNA 免疫沉淀的发展以及高通量测序（RIP-和 DIP-seq）引发了详细的转录组和全基因组研究。这两种技术都依赖于高度特异性和敏感的抗体来特异性富集靶向修饰的核苷酸，而没有背景或潜在的偏差。在这里，我们回顾了生成和验证针对修饰核苷酸的抗体时面临的挑战和发展。我们讨论抗体-抗原相互作用、不同的抗原生成策略，并比较适合最先进的高分辨率绘图和成像技术的不同结合剂形式。
Nucleotide modifications constitute marks in RNA and DNA that contribute to gene regulation, development and other cellular processes. The understanding of their intricate molecular roles has been hampered by the high number of different modifications, the lack of effective methods and tools for their detection and quantification as well as by their complex structure-function relationship. The recent development of RNA and DNA immunoprecipitation followed by high-throughput sequencing (RIP- and DIP-seq) initiated detailed transcriptome- and genome-wide studies. Both techniques depend on highly specific and sensitive antibodies to specifically enrich the targeted modified nucleotides without background or potential biases. Here, we review the challenges and developments when generating and validating antibodies targeting modified nucleotides. We discuss antibody-antigen interactions, different strategies of antigen generation and compare different binder formats suitable for state-of-the-art high resolution mapping and imaging technologies.
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影响因子：
14.9
作者：
Bodi Z;Button JD;Grierson D;Fray RG
通讯作者：
Fray RG
影响因子：
16.6
作者：
Chen, Kai;Lu, Zhike;Wang, Xiao;Fu, Ye;Luo, Guan-Zheng;Liu, Nian;Han, Dali;Dominissini, Dan;Dai, Qing;Pan, Tao;He, Chuan
通讯作者：
He, Chuan
DOI：
10.1111/j.1432-1033.1987.tb13439.x
发表时间：
1987-10-15
期刊：
EUROPEAN JOURNAL OF BIOCHEMISTRY
影响因子：
--
作者：
BOCHNIG, P;REUTER, R;LUHRMANN, R
通讯作者：
LUHRMANN, R
影响因子：
64.8
作者：
CHOTHIA, C;LESK, AM;POLJAK, RJ
通讯作者：
POLJAK, RJ
抗体发现的天然和人造V基因曲目。
影响因子：
7.3
作者：
Finlay WJ;Almagro JC
通讯作者：
Almagro JC