Genetic consequences of Pleistocene fragmentation: Isolation, drift, and loss of diversity in rock iguanas (Cyclura)

Genetic consequences of Pleistocene fragmentation: Isolation, drift, and loss of diversity in rock iguanas (Cyclura)
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更新世破碎化的遗传后果:岩鬣蜥的隔离、漂移和多样性丧失(Cyclura)

DOI:
--
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发表时间:
2004
影响因子:
2.2
通讯作者:
S. K. Davis
S. K. Davis
中科院分区:
环境科学与生态学3区
文献类型:
--
作者:
C. Malone;C. R. Knapp;Jeremy F. Taylor;S. K. Davis

文献摘要

参考文献

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更新世大巴哈马银行的分裂导致了一个大的和几个小种群的岩鬣蜥(Cycluracychlura)。我们利用线粒体序列数据(部分ND 4到tRNALeu)结合8个多态性微卫星位点(2到10个等位基因)来探索这些岛屿种群内部和之间的遗传变异模式。遗传数据支持两个不同的地理群体,安德罗斯岛和埃克苏马群岛。这一结果与目前的亚种分类学相冲突,其中三个亚种被描述。等位基因数据分析表明,大多数岛屿人口目前是人口独立的。8个群体间的成对Fst值在0.18 ~ 0.63之间,135个个体中有6个在分配检验中被误分配。群体遗传多样性的特征是使用标准的措施,如等位基因和杂合度(H)的数量,除了一个标准化的香农-韦弗多样性指数(D)。我们发现安德罗斯岛种群的遗传多样性与其他非鱼类动物的遗传多样性(平均值)相当。等位基因数= 5,平均H = 0.56,平均值D = 0.66),而在埃克苏马群岛的人口,这些措施要低得多(平均。等位基因数= 2.75-1.625,平均H = 0.43-0.17,平均D = 0.45-0.18)。这些数据被用来讨论保护管理策略,包括优先级和易位。
Pleistocene fragmentation of the Great BahamaBank resulted in one large and several smallpopulations of rock iguanas (Cycluracychlura). We explore patterns of geneticvariation within and among these islandpopulations using mitochondrial sequence data(partial ND4 to tRNALeu) in combinationwith eight polymorphic microsatellite loci (2to 10 alleles). Genetic data support twophylogeographically distinct groups, AndrosIsland and the Exuma cays. This resultconflicts with current subspecific taxonomy inwhich three subspecies are described. Analysesof allelic data indicate that most islandpopulations are currently demographicallyindependent. Pairwise Fst values between eightisland populations range from 0.18 to 0.63, and6 of 135 individuals are misassigned in anassignment test. Population-genetic diversityis characterized using standard measures suchas number of alleles and heterozygosity (H) inaddition to a normalized Shannon-Weaver indexof diversity (D). We find genetic diversity inthe Andros Island population comparable to thatin other non-piscine animals (avg. # ofalleles = 5, avg. H = 0.56, avg. D = 0.66) while inthe Exuma cays populations these measures aremuch lower (avg. # of alleles = 2.75–1.625, avg.H = 0.43–0.17, avg. D = 0.45–0.18). These dataare used to discuss conservation managementstrategies, including prioritization andtranslocation.
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