Pervasive lesion segregation shapes cancer genome evolution
Pervasive lesion segregation shapes cancer genome evolution
复制标题
普遍的病变分离塑造癌症基因组进化
DOI：
10.1101/868679
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发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Aitken S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Aitken S
癌症通过获得致癌突变而产生，并通过克隆扩增而生长。在这里，我们发现大多数诱变性DNA损伤在单个细胞周期内不会分解成突变的DNA碱基对。相反，DNA损伤分离，未修复，进入多代细胞的子细胞，导致随后突变的染色体尺度分期。我们在诱变剂诱导的小鼠肝肿瘤中描述了这一过程，并表明持续病变的DNA复制可以在连续的细胞分裂中产生多个替代等位基因，从而产生多等位基因和组合遗传多样性。病变的分期能够精确测量链偏向修复过程，量化致癌选择和精细绘制姐妹染色单体交换事件。最后，我们证明了病变分离是外源诱变剂的一个统一特性，包括人类细胞和肿瘤中的紫外线和化疗药物，这对癌症基因组的进化和适应具有深远的意义。
Cancers arise through the acquisition of oncogenic mutations and grow by clonal expansion,. Here we reveal that most mutagenic DNA lesions are not resolved into a mutated DNA base pair within a single cell cycle. Instead, DNA lesions segregate, unrepaired, into daughter cells for multiple cell generations, resulting in the chromosome-scale phasing of subsequent mutations. We characterize this process in mutagen-induced mouse liver tumours and show that DNA replication across persisting lesions can produce multiple alternative alleles in successive cell divisions, thereby generating both multiallelic and combinatorial genetic diversity. The phasing of lesions enables accurate measurement of strand-biased repair processes, quantification of oncogenic selection and fine mapping of sister-chromatid-exchange events. Finally, we demonstrate that lesion segregation is a unifying property of exogenous mutagens, including UV light and chemotherapy agents in human cells and tumours, which has profound implications for the evolution and adaptation of cancer genomes.
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影响因子：
64.5
作者：
Petljak, Mia;Alexandrov, Ludmil B.;Stratton, Michael R.
通讯作者：
Stratton, Michael R.
影响因子：
9.3
作者：
Durand NC;Shamim MS;Machol I;Rao SS;Huntley MH;Lander ES;Aiden EL
通讯作者：
Aiden EL
转录偶联修复：从细胞到单分子，然后再返回。
影响因子：
5.6
作者：
Terence R. Strick;J. R. Portman;J. R. Portman
通讯作者：
J. R. Portman
DOI：
10.1073/pnas.0906681106
发表时间：
2009-12-08
影响因子：
11.1
作者：
Parkhomchuk, D.;Amstislavskiy, V.;Ogryzko, V.
通讯作者：
Ogryzko, V.
DOI：
10.1016/j.mrfmmm.2007.08.015
发表时间：
2008-02-01
影响因子：
2.3
作者：
Buchmann, Albrecht;Karcier, Zuleyha;Schwarz, Michael
通讯作者：
Schwarz, Michael