Ultra-low-input, tagmentation-based whole-genome bisulfite sequencing.
Ultra-low-input, tagmentation-based whole-genome bisulfite sequencing.
复制标题
超低输入，基于标记的全基因组硫酸盐测序。
DOI：
10.1101/gr.136242.111
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发表时间：
2012-06
期刊：
影响因子：
7
通讯作者：
Shendure J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Adey A;Shendure J
我们已经将基于转座酶的体外鸟枪文库构建（“标签化”）用于全基因组亚硫酸氢盐测序。这种方法Tn 5 mC-seq能够使起始材料相对于常规方案减少>100倍，使得我们从少至IOng的输入DNA产生高度复杂的亚硫酸氢盐测序文库，并且从Ing的输入DNA产生大量有用的序列。我们通过对人类淋巴母细胞系的甲基化组进行测序，以证明Tn 5 mC-seq，每条链的高质量覆盖率为8.6倍。
We have adapted transposase-based in vitro shotgun library construction (“tagmentation”) for whole-genome bisulfite sequencing. This method, Tn5mC-seq, enables a >100-fold reduction in starting material relative to conventional protocols, such that we generate highly complex bisulfite sequencing libraries from as little as 10 ng of input DNA, and ample useful sequences from 1 ng of input DNA. We demonstrate Tn5mC-seq by sequencing the methylome of a human lymphoblastoid cell line to ∼8.6× high-quality coverage of each strand.
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影响因子：
46.9
作者：
Ball, Madeleine P.;Li, Jin Billy;Gao, Yuan;Lee, Je-Hyuk;LeProust, Emily M.;Park, In-Hyun;Xie, Bin;Daley, George Q.;Church, George M.
通讯作者：
Church, George M.
影响因子：
46.9
作者：
Deng, Jie;Shoemaker, Robert;Xie, Bin;Gore, Athurva;LeProust, Emily M.;Antosiewicz-Bourget, Jessica;Egli, Dieter;Maherali, Nimet;Park, In-Hyun;Yu, Junying;Daley, George Q.;Eggan, Kevin;Hochedlinger, Konrad;Thomson, James;Wang, Wei;Gao, Yuan;Zhang, Kun
通讯作者：
Zhang, Kun
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作者：
CLARK, SJ;HARRISON, J;FROMMER, M
通讯作者：
FROMMER, M
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
12.3
作者：
Adey A;Morrison HG;Asan;Xun X;Kitzman JO;Turner EH;Stackhouse B;MacKenzie AP;Caruccio NC;Zhang X;Shendure J
通讯作者：
Shendure J