The IntAct molecular interaction database in 2012.
The IntAct molecular interaction database in 2012.
复制标题
DOI：
10.1093/nar/gkr1088
复制
发表时间：
2012-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Hermjakob H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kerrien S;Aranda B;Breuza L;Bridge A;Broackes-Carter F;Chen C;Duesbury M;Dumousseau M;Feuermann M;Hinz U;Jandrasits C;Jimenez RC;Khadake J;Mahadevan U;Masson P;Pedruzzi I;Pfeiffenberger E;Porras P;Raghunath A;Roechert B;Orchard S;Hermjakob H
IntAct是一个开源、开放数据的分子相互作用数据库，由文献或直接数据沉积中的数据填充。数据库中现在有两个级别的管理，目前支持IMEx级别的注释和不太详细的MIMix兼容条目。截至2011年9月，IntAct包含来自5000多篇出版物的约275000个精选的二元相互作用证据。对IntAct网站进行了改进，以加强搜索过程，特别是搜索结果的图形显示。还提供了新的数据下载格式，这将有助于将IntAct的数据纳入语义网。IntAct是IMEx联盟（http：//www.example.com）的积极贡献者。www.imexconsortium.org IntAct源代码和数据可在http://www.ebi.ac.uk/intact上免费获得。
IntAct is an open-source, open data molecular interaction database populated by data either curated from the literature or from direct data depositions. Two levels of curation are now available within the database, with both IMEx-level annotation and less detailed MIMIx-compatible entries currently supported. As from September 2011, IntAct contains approximately 275 000 curated binary interaction evidences from over 5000 publications. The IntAct website has been improved to enhance the search process and in particular the graphical display of the results. New data download formats are also available, which will facilitate the inclusion of IntAct's data in the Semantic Web. IntAct is an active contributor to the IMEx consortium (http://www.imexconsortium.org). IntAct source code and data are freely available at http://www.ebi.ac.uk/intact.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp602
发表时间：
2010-01-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Niu Y;Otasek D;Jurisica I
通讯作者：
Jurisica I
影响因子：
14.9
作者：
Kersey PJ;Lawson D;Birney E;Derwent PS;Haimel M;Herrero J;Keenan S;Kerhornou A;Koscielny G;Kähäri A;Kinsella RJ;Kulesha E;Maheswari U;Megy K;Nuhn M;Proctor G;Staines D;Valentin F;Vilella AJ;Yates A
通讯作者：
Yates A
影响因子：
14.9
作者：
Ceol A;Chatr Aryamontri A;Licata L;Peluso D;Briganti L;Perfetto L;Castagnoli L;Cesareni G
通讯作者：
Cesareni G
影响因子：
9.9
作者：
Lynn, David J.;Winsor, Geoffrey L.;Chan, Calvin;Richard, Nicolas;Laird, Matthew R.;Barsky, Aaron;Gardy, Jennifer L.;Roche, Fiona M.;Chan, Timothy H. W.;Shah, Naisha;Lo, Raymond;Naseer, Misbah;Que, Jaimmie;Yau, Melissa;Acab, Michael;Tulpan, Dan;Whiteside, Matthew D.;Chikatamarla, Avinash;Mah, Bernadette;Munzner, Tamara;Hokamp, Karsten;Hancock, Robert E. W.;Brinkman, Fiona S. L.
通讯作者：
Brinkman, Fiona S. L.
DOI：
10.1093/bioinformatics/btq430
发表时间：
2010-09-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Lopes CT;Franz M;Kazi F;Donaldson SL;Morris Q;Bader GD
通讯作者：
Bader GD