Porous Zero-Mode Waveguides for Picogram-Level DNA Capture.
Porous Zero-Mode Waveguides for Picogram-Level DNA Capture.
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DOI：
10.1021/acs.nanolett.8b04170
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发表时间：
2019-02-13
期刊：
影响因子：
10.8
通讯作者：
Wanunu, Meni
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Jadhav, Vivek;Hoogerheide, David P.;Korlach, Jonas;Wanunu, Meni
我们最近已经表明，纳米孔零模式波导是有效的工具，用于捕获皮克级的长DNA片段的单分子DNA测序。尽管有这些关键优势，但由于需要连续纳米孔制造，大阵列的制造是不实际的。为了克服这一挑战，我们已经开发出一种方法，用于在低成本的多孔膜上的波导阵列的晶圆级制造，该多孔膜是使用分子层沉积来沉积的。每个波导基底处的膜包含蛇形孔的网络，其允许皮克级的有效电泳DNA捕获，同时消除对禁止的连续孔研磨的需要。在这里，我们表明，这些多孔波导的负载效率比它们的纳米孔前辈高出2个数量级。这种新设备有助于扩大工艺规模，大大降低了制造成本和工作量。此外，多孔零模式波导可用于受益于低输入单分子实时测序的应用。
We have recently shown that nanopore zero-mode waveguides are effective tools for capturing picogram levels of long DNA fragments for single-molecule DNA sequencing. Despite these key advantages, the manufacturing of large arrays is not practical due to the need for serial nanopore fabrication. To overcome this challenge, we have developed an approach for the wafer-scale fabrication of waveguide arrays on low-cost porous membranes, which are deposited using molecular-layer deposition. The membrane at each waveguide base contains a network of serpentine pores that allows for efficient electrophoretic DNA capture at picogram levels while eliminating the need for prohibitive serial pore milling. Here, we show that the loading efficiency of these porous waveguides is up to 2 orders of magnitude greater than their nanopore predecessors. This new device facilitates the scaling-up of the process, greatly reducing the cost and effort of manufacturing. Furthermore, the porous zero-mode waveguides can be used for applications that benefit from low-input single-molecule real-time sequencing.
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影响因子：
46.9
作者：
Jain M;Olsen HE;Turner DJ;Stoddart D;Bulazel KV;Paten B;Haussler D;Willard HF;Akeson M;Miga KH
通讯作者：
Miga KH
影响因子：
7
作者：
Huddleston J;Chaisson MJP;Steinberg KM;Warren W;Hoekzema K;Gordon D;Graves-Lindsay TA;Munson KM;Kronenberg ZN;Vives L;Peluso P;Boitano M;Chin CS;Korlach J;Wilson RK;Eichler EE
通讯作者：
Eichler EE
影响因子：
48
作者：
Flusberg, Benjamin A.;Webster, Dale R.;Lee, Jessica H.;Travers, Kevin J.;Olivares, Eric C.;Clark, Tyson A.;Korlach, Jonas;Turner, Stephen W.
通讯作者：
Turner, Stephen W.
影响因子：
12.3
作者：
Koren S;Harhay GP;Smith TP;Bono JL;Harhay DM;Mcvey SD;Radune D;Bergman NH;Phillippy AM
通讯作者：
Phillippy AM
DOI：
10.1126/science.aae0344
发表时间：
2016-04-01
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Gordon D;Huddleston J;Chaisson MJ;Hill CM;Kronenberg ZN;Munson KM;Malig M;Raja A;Fiddes I;Hillier LW;Dunn C;Baker C;Armstrong J;Diekhans M;Paten B;Shendure J;Wilson RK;Haussler D;Chin CS;Eichler EE
通讯作者：
Eichler EE