VIDA: a virus database system for the organization of animal virus genome open reading frames.
VIDA: a virus database system for the organization of animal virus genome open reading frames.
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DOI：
10.1093/nar/29.1.133
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发表时间：
2001-01-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kellam P
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Albà MM;Lee D;Pearl FM;Shepherd AJ;Martin N;Orengo CA;Kellam P
VIDA是一种新的病毒数据库，它从动物病毒的部分和完整基因组序列中组织开放阅读框架(ORF)。目前VIDA包括GenBank中疱疹病毒科、冠状病毒科和动脉病毒科的所有序列。ORF被组织成同源蛋白家族，根据序列相似性关系进行鉴定。具有潜在功能重要性的保守序列区域被鉴定，并可作为序列比对检索。我们对数据库中的所有蛋白质和蛋白质家族使用受控的分类和功能分类。当可用时，与家族相关的蛋白质结构也被包括在内。该数据库可在http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/virus_database/VIDA.html.上进行在线搜索和序列信息检索
VIDA is a new virus database that organizes open reading frames (ORFs) from partial and complete genomic sequences from animal viruses. Currently VIDA includes all sequences from GenBank for Herpesviridae, Coronaviridae and Arteriviridae. The ORFs are organized into homologous protein families, which are identified on the basis of sequence similarity relationships. Conserved sequence regions of potential functional importance are identified and can be retrieved as sequence alignments. We use a controlled taxonomical and functional classification for all the proteins and protein families in the database. When available, protein structures that are related to the families have also been included. The database is available for online search and sequence information retrieval at http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/virus_database/VIDA.html.
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影响因子：
13.8
作者：
Tamames, J;Tramontano, A
通讯作者：
Tramontano, A
影响因子：
14.9
作者：
Shafer, RW;Jung, DR;Gonzales, MJ
通讯作者：
Gonzales, MJ
DOI：
10.1073/pnas.97.10.5334
发表时间：
2000-05-09
影响因子：
11.1
作者：
Montague, MG;Hutchison, CA
通讯作者：
Hutchison, CA
影响因子：
14.9
作者：
Kantor, R;Machekano, R;Shafer, RW
通讯作者：
Shafer, RW
影响因子：
14.9
作者：
Wheeler, DL;Church, DM;Rapp, BA
通讯作者：
Rapp, BA