Nucleic acid modifications with epigenetic significance.
Nucleic acid modifications with epigenetic significance.
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DOI：
10.1016/j.cbpa.2012.10.002
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发表时间：
2012-12
影响因子：
7.8
通讯作者：
He, Chuan
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fu, Ye;He, Chuan
表观遗传修饰影响基因表达而不改变潜在的核酸序列。除了众所周知的5-甲基胞嘧啶（5mC）外，最近在基因组DNA中发现了5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）， 5-甲酰胞嘧啶（5fC）和5-羧胞嘧啶（5caC），它们都是由TET （Ten-Eleven-Translocate）家族酶对5mC的迭代氧化引起的。最近的研究提出了这些氧化胞嘧啶在介导5mC活性去甲基化中的作用。通过基于亲和的全基因组测序和氧化辅助碱基分辨率测序方法，发现5hmC在发育过程中受到动态调控，并且在人和小鼠胚胎细胞中主要富集于远端调控元件。在RNA修饰中，n6 -甲基腺苷（m6A）是mRNA和非编码RNA中广泛存在但研究较少的碱基修饰。最近发现，RNA中的m6A是脂肪质量和肥胖相关（FTO）蛋白的主要底物，这引起了人们对可逆RNA甲基化的潜在调节功能的关注，这可能是动态的，并且在许多基本细胞功能中可能是重要的。
Epigenetic modifications influence gene expression without alterations to the underlying nucleic acid sequence. In addition to the well-known 5-methylcytosine (5mC), 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), 5-formylcytosine (5fC), and 5-carboxycytosine (5caC) have recently been discovered in genomic DNA, which all result from iterative oxidation of 5mC by the TET (Ten-Eleven-Translocate) family of enzymes. Recent studies have proposed the roles of these oxidized cytosines in mediating active demethylation of 5mC. Through affinity-based genome-wide sequencing and oxidation-assisted base-resolution sequencing methods, 5hmC is found to be dynamically regulated during development, and is enriched mainly in distal regulatory elements in human and mouse embryonic cells. Among RNA modifications, N6-methyladenosine (m6A) is a widespread yet poorly-studied base modification in mRNA and non-coding RNA. The recent discovery that m6A in RNA is the major substrate of the fat mass and obesity associated (FTO) protein draws attention to the potential regulatory functions of reversible RNA methylations, which can be dynamic, and could be important in many fundamental cellular functions.
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