Remodeling the chromatin landscape in T lymphocytes by a division of labor among transcription factors.
Remodeling the chromatin landscape in T lymphocytes by a division of labor among transcription factors.
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DOI：
10.1111/imr.12942
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发表时间：
2021-03
影响因子：
8.7
通讯作者：
Vahedi G
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Vahedi G
为了将真核生物的基因组放入细胞核内，需要一种非同寻常的浓缩。这种紧凑是通过首先将DNA缠绕在称为核小体的结构周围来实现的。哺乳动物的基因组进一步折叠成复杂的三维(3D)配置，使遗传密码能够决定一系列不同的细胞命运。分子和计算技术的最新进展使得以前所未有的分辨率和规模查询高阶染色质结构成为可能。在T淋巴细胞中，类似于其他发育程序，不同类别的序列特异性转录因子之间的高度协调分工形成了分层的基因组组织。在这篇综述中，我们将总结一维和三维基因组组织的一般原理，介绍测量多层染色质组织的常用实验和计算技术，并讨论转录因子在T淋巴细胞染色质组织中的普遍作用。
An extraordinary degree of condensation is required to fit the eukaryotic genome inside the nucleus. This compaction is attained by first coiling the DNA around structures called nucleosomes. Mammalian genomes are further folded into sophisticated three-dimensional (3D) configurations, enabling the genetic code to dictate a diverse range of cell fates. Recent advances in molecular and computational technologies have enabled the query of higher-order chromatin architecture at an unprecedented resolution and scale. In T lymphocytes, similar to other developmental programs, the hierarchical genome organization is shaped by a highly coordinated division of labor among different classes of sequence-specific transcription factors. In this review, we will summarize the general principles of 1D and 3D genome organization, introduce the common experimental and computational techniques to measure the multilayer chromatin organization, and discuss the pervasive role of transcription factors on chromatin organization in T lymphocytes.
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