Recent progress and prospects for advancing arachnid genomics.
Recent progress and prospects for advancing arachnid genomics.
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DOI：
10.1016/j.cois.2017.11.005
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发表时间：
2018-03
影响因子：
5.3
通讯作者：
Ayoub NA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Garb JE;Sharma PP;Ayoub NA
蛛形纲动物表现出巨大的物种丰富性和适应生物医学，工业和农业的重要性。然而，蛛形纲动物的基因组资源是有限的，在过去的四年里，第一批蜘蛛和蝎子的基因组变得可用。我们回顾了这些基因组计划的关键见解，并推荐了更多的基因组测序，强调对科学界最有价值的类群。我们建议对那些基因组研究不足，但拥有重要的蛋白质配方的蜘蛛进行更大的采样，以产生蛛丝和毒液。我们进一步建议蜘蛛基因组来解决重要的进化主题，包括基因组重复的表型影响。高质量的蛛形纲动物基因组的一个障碍是完全基于短读数据的组装，这可以通过长距离测序和其他新兴方法来克服。
Arachnids exhibit tremendous species richness and adaptations of biomedical, industrial, and agricultural importance. Yet genomic resources for arachnids are limited, with the first few spider and scorpion genomes becoming accessible in the last four years. We review key insights from these genome projects, and recommend additional genomes for sequencing, emphasizing taxa of greatest value to the scientific community. We suggest greater sampling of spiders whose genomes are understudied but hold important protein recipes for silk and venom production. We further recommend arachnid genomes to address significant evolutionary topics, including the phenotypic impact of genome duplications. A barrier to high-quality arachnid genomes are assemblies based solely on short-read data, which may be overcome by long-range sequencing and other emerging methods.
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影响因子：
2.7
作者：
Garrison NL;Rodriguez J;Agnarsson I;Coddington JA;Griswold CE;Hamilton CA;Hedin M;Kocot KM;Ledford JM;Bond JE
通讯作者：
Bond JE
影响因子：
16.6
作者：
Gulia-Nuss M;Nuss AB;Meyer JM;Sonenshine DE;Roe RM;Waterhouse RM;Sattelle DB;de la Fuente J;Ribeiro JM;Megy K;Thimmapuram J;Miller JR;Walenz BP;Koren S;Hostetler JB;Thiagarajan M;Joardar VS;Hannick LI;Bidwell S;Hammond MP;Young S;Zeng Q;Abrudan JL;Almeida FC;Ayllón N;Bhide K;Bissinger BW;Bonzon-Kulichenko E;Buckingham SD;Caffrey DR;Caimano MJ;Croset V;Driscoll T;Gilbert D;Gillespie JJ;Giraldo-Calderón GI;Grabowski JM;Jiang D;Khalil SMS;Kim D;Kocan KM;Koči J;Kuhn RJ;Kurtti TJ;Lees K;Lang EG;Kennedy RC;Kwon H;Perera R;Qi Y;Radolf JD;Sakamoto JM;Sánchez-Gracia A;Severo MS;Silverman N;Šimo L;Tojo M;Tornador C;Van Zee JP;Vázquez J;Vieira FG;Villar M;Wespiser AR;Yang Y;Zhu J;Arensburger P;Pietrantonio PV;Barker SC;Shao R;Zdobnov EM;Hauser F;Grimmelikhuijzen CJP;Park Y;Rozas J;Benton R;Pedra JHF;Nelson DR;Unger MF;Tubio JMC;Tu Z;Robertson HM;Shumway M;Sutton G;Wortman JR;Lawson D;Wikel SK;Nene VM;Fraser CM;Collins FH;Birren B;Nelson KE;Caler E;Hill CA
通讯作者：
Hill CA
影响因子：
4.1
作者：
Barnett AA;Thomas RH
通讯作者：
Thomas RH
影响因子：
6.2
作者：
Jain, Dharamdeep;Zhang, Ci;Dhinojwala, Ali
通讯作者：
Dhinojwala, Ali
影响因子：
4.2
作者：
Dardevet L;Rani D;Aziz TA;Bazin I;Sabatier JM;Fadl M;Brambilla E;De Waard M
通讯作者：
De Waard M