The dynamics of gene expression in vertebrate embryogenesis at single-cell resolution.
The dynamics of gene expression in vertebrate embryogenesis at single-cell resolution.
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DOI：
10.1126/science.aar5780
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发表时间：
2018-06-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Klein AM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Briggs JA;Weinreb C;Wagner DE;Megason S;Peshkin L;Kirschner MW;Klein AM
单细胞转录组测量的时间序列可以揭示细胞分化途径的动态特征。从测量整个青蛙胚胎跨越合子基因组激活通过早期器官形成，我们得出了一个详细的目录中的细胞状态在脊椎动物的发展和地图的分化在所有谱系随着时间的推移。推断的地图概括了大多数，如果不是所有的发展关系，并与新的监管机构和标记基因与每个细胞状态。我们发现，许多胚胎细胞状态比以前认识到的更早出现。我们还评估了神经嵴发育的相互冲突的模型。从一个配套文件中的斑马鱼发育匹配的时间序列，我们揭示了脊椎动物早期发育基因表达程序的保守和分歧的特点。
Time series of single-cell transcriptome measurements can reveal dynamic features of cell differentiation pathways. From measurements of whole frog embryos spanning zygotic genome activation through early organogenesis, we derived a detailed catalog of cell states in vertebrate development and a map of differentiation across all lineages over time. The inferred map recapitulates most if not all developmental relationships and associates new regulators and marker genes with each cell state. We find that many embryonic cell states appear earlier than previously appreciated. We also assess conflicting models of neural crest development. Incorporating a matched time series of zebrafish development from a companion paper, we reveal conserved and divergent features of vertebrate early developmental gene expression programs.
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