A humanized nanobody phage display library yields potent binders of SARS CoV-2 spike.
A humanized nanobody phage display library yields potent binders of SARS CoV-2 spike.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0272364
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发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
针对SARS-CoV-2刺突蛋白的中和抗体已显示出巨大的预防/治疗潜力。在这里，我们报告了一种快速而有效的策略，用于开发和设计具有亚纳米分子亲和力和纳米分子势的SARS-CoV-2中和人源化纳米体结构。基于低温电子显微镜的结构分析揭示了两种截然不同的结合模式。最有效的纳米体，RBD-1-2G(NCATS-BL8125)，耐受N501Y RBD突变，并仍然能够中和B.1.1.7(Alpha)变体。分子动力学模拟为理解专门关注RBD上有和没有N501Y突变的Spike-ACE2界面的纳米体的中和过程提供了结构基础。初步建立的人呼吸道空气-肺界面(ALI)体外模型显示，RBD-1-2G-Fc抗体治疗可有效降低WA1和B.1.1.7SARS-CoV-2感染后的病毒载量。因此，这一提出的战略将作为一种工具来减轻新出现的SARS-CoV-2变种的威胁。
Neutralizing antibodies targeting the SARS-CoV-2 spike protein have shown a great preventative/therapeutic potential. Here, we report a rapid and efficient strategy for the development and design of SARS-CoV-2 neutralizing humanized nanobody constructs with sub-nanomolar affinities and nanomolar potencies. CryoEM-based structural analysis of the nanobodies in complex with spike revealed two distinct binding modes. The most potent nanobody, RBD-1-2G(NCATS-BL8125), tolerates the N501Y RBD mutation and remains capable of neutralizing the B.1.1.7 (Alpha) variant. Molecular dynamics simulations provide a structural basis for understanding the neutralization process of nanobodies exclusively focused on the spike-ACE2 interface with and without the N501Y mutation on RBD. A primary human airway air-lung interface (ALI) ex vivo model showed that RBD-1-2G-Fc antibody treatment was effective at reducing viral burden following WA1 and B.1.1.7 SARS-CoV-2 infections. Therefore, this presented strategy will serve as a tool to mitigate the threat of emerging SARS-CoV-2 variants.
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SARS-COV-2血统的估计可传播和影响B.1.1.7在英国。
DOI：
10.1126/science.abg3055
发表时间：
2021-04-09
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Davies NG;Abbott S;Barnard RC;Jarvis CI;Kucharski AJ;Munday JD;Pearson CAB;Russell TW;Tully DC;Washburne AD;Wenseleers T;Gimma A;Waites W;Wong KLM;van Zandvoort K;Silverman JD;CMMID COVID-19 Working Group;COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium;Diaz-Ordaz K;Keogh R;Eggo RM;Funk S;Jit M;Atkins KE;Edmunds WJ
通讯作者：
Edmunds WJ
影响因子：
64.8
作者：
Li W;Moore MJ;Vasilieva N;Sui J;Wong SK;Berne MA;Somasundaran M;Sullivan JL;Luzuriaga K;Greenough TC;Choe H;Farzan M
通讯作者：
Farzan M
影响因子：
8
作者：
Dumoulin, M;Conrath, K;Matagne, A
通讯作者：
Matagne, A
DOI：
10.1007/978-1-4939-6887-9_5
发表时间：
2017-01-01
期刊：
HETEROLOGOUS GENE EXPRESSION IN E. COLI: METHODS AND PROTOCOLS
影响因子：
--
作者：
Taylor, Troy;Denson, John-Paul;Esposito, Dominic
通讯作者：
Esposito, Dominic
影响因子：
14.8
作者：
通讯作者：
--