Light and temperature shape nuclear architecture and gene expression.
Light and temperature shape nuclear architecture and gene expression.
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DOI：
10.1016/j.pbi.2018.05.018
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发表时间：
2018-10
影响因子：
9.5
通讯作者：
Davidson ML
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kaiserli E;Perrella G;Davidson ML
拟南芥和水稻的染色体组在三维结构上表现出多样性。光引发基因组拓扑结构和转录活性的变化。植物光感受器控制细胞核形态和染色质结构。温度波动改变局部染色质结构和转录活性。环境刺激在调节植物整个生命周期的生长和发育中起着重要作用。光和温度的定量和定性变化触发基因表达的变化，最终形成植物形态的适应和生存。尽管植物对不断变化的环境的反应的表型和转录组学基础已经研究了几十年，但核结构的全球变化与对环境刺激的适应之间的关系才刚刚被发现。本文介绍了最近的发现，调查如何在光和温度的变化触发染色质结构和核组织的变化，重点是基因的重新定位和染色质的可及性在调节基因表达的作用。
Arabidopsis and rice genomes exhibit diversity in chromatin organization in three-dimension. Light triggers changes in genome topology and transcriptional activity. Plant photoreceptors control nuclear morphology and chromatin architecture. Temperature fluctuations modify local chromatin structure and transcriptional activity. Environmental stimuli play a major role in modulating growth and development throughout the life-cycle of a plant. Quantitative and qualitative variations in light and temperature trigger changes in gene expression that ultimately shape plant morphology for adaptation and survival. Although the phenotypic and transcriptomic basis of plant responses to the constantly changing environment have been examined for decades, the relationship between global changes in nuclear architecture and adaption to environmental stimuli is just being uncovered. This review presents recent discoveries investigating how changes in light and temperature trigger changes in chromatin structure and nuclear organization with a focus on the role of gene repositioning and chromatin accessibility in regulating gene expression.
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影响因子：
64.5
作者：
Dekker J;Mirny L
通讯作者：
Mirny L
DOI：
10.1073/pnas.1503512112
发表时间：
2015-05-26
影响因子：
11.1
作者：
Bourbousse, Clara;Mestiri, Imen;Barneche, Fredy
通讯作者：
Barneche, Fredy
由局部 A/B 区室确定的大型植物基因组的 3D 染色质结构。
影响因子：
27.5
作者：
Dong, Pengfei;Tu, Xiaoyu;Zhong, Silin
通讯作者：
Zhong, Silin
DOI：
10.1111/tpj.13601
发表时间：
2017-08
期刊：
The Plant journal : for cell and molecular biology
影响因子：
--
作者：
Dreissig S;Schiml S;Schindele P;Weiss O;Rutten T;Schubert V;Gladilin E;Mette MF;Puchta H;Houben A
通讯作者：
Houben A
影响因子：
16.6
作者：
Feng CM;Qiu Y;Van Buskirk EK;Yang EJ;Chen M
通讯作者：
Chen M