Universal Spectrum Identifier for mass spectra.

Universal Spectrum Identifier for mass spectra.
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DOI:
10.1038/s41592-021-01184-6
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发表时间:
2021-07
期刊:
影响因子:
48
通讯作者:
Bandeira N
Bandeira N
中科院分区:
生物学1区
文献类型:
--
作者:
Deutsch EW;Perez-Riverol Y;Carver J;Kawano S;Mendoza L;Van Den Bossche T;Gabriels R;Binz PA;Pullman B;Sun Z;Shofstahl J;Bittremieux W;Mak TD;Klein J;Zhu Y;Lam H;Vizcaíno JA;Bandeira N

文献摘要

参考文献

被引文献

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质谱为支持发表的质谱(MS)蛋白质组学研究结果提供了最终证据,因此能够将结论追溯到光谱是至关重要的。通用谱标识符(USI)提供了一种标准化机制,用于编码包含在存储到公共蛋白质组学存储库的数据集中的任何质谱的虚拟路径。USI为提供光谱证据提供了更高的透明度,通过ProteomeXchange (PX)存储库已经可以从超过30亿个光谱中获得超过10亿个USI鉴定。
Mass spectra provide the ultimate evidence for supporting the findings of mass spectrometry (MS) proteomics studies in publications, and it is therefore crucial to be able to trace the conclusions back to the spectra. The Universal Spectrum Identifier (USI) provides a standardized mechanism for encoding a virtual path to any mass spectrum contained in datasets deposited to public proteomics repositories. USIs enable greater transparency for providing spectral evidence, with more than 1 billion USI identifications from over 3 billion spectra already available through ProteomeXchange (PX) repositories.
DOI: 10.1093/nar/gky869
发表时间: 2019-01-08
影响因子: 14.9
作者:
Ma J;Chen T;Wu S;Yang C;Bai M;Shu K;Li K;Zhang G;Jin Z;He F;Hermjakob H;Zhu Y
通讯作者: Zhu Y
DOI: 10.1093/nar/gky899
发表时间: 2019-01-08
影响因子: 14.9
作者:
Moriya Y;Kawano S;Okuda S;Watanabe Y;Matsumoto M;Takami T;Kobayashi D;Yamanouchi Y;Araki N;Yoshizawa AC;Tabata T;Iwasaki M;Sugiyama N;Tanaka S;Goto S;Ishihama Y
通讯作者: Ishihama Y
DOI: 10.1021/acs.jproteome.0c00485
发表时间: 2020-12-04
影响因子: 4.4
作者:
Omenn GS;Lane L;Overall CM;Cristea IM;Corrales FJ;Lindskog C;Paik YK;Van Eyk JE;Liu S;Pennington SR;Snyder MP;Baker MS;Bandeira N;Aebersold R;Moritz RL;Deutsch EW
通讯作者: Deutsch EW
DOI: 10.1093/nar/gkw936
发表时间: 2017-01-04
影响因子: 14.9
作者:
Deutsch EW;Csordas A;Sun Z;Jarnuczak A;Perez-Riverol Y;Ternent T;Campbell DS;Bernal-Llinares M;Okuda S;Kawano S;Moritz RL;Carver JJ;Wang M;Ishihama Y;Bandeira N;Hermjakob H;Vizcaíno JA
通讯作者: Vizcaíno JA
DOI: 10.1021/acs.jproteome.9b00542
发表时间: 2019-12-01
影响因子: 4.4
作者:
Deutsch, Eric W.;Lane, Lydie;Omenn, Gilbert S.
通讯作者: Omenn, Gilbert S.