Differential Expression Gene Explorer (DrEdGE): a tool for generating interactive online visualizations of gene expression datasets
Differential Expression Gene Explorer (DrEdGE): a tool for generating interactive online visualizations of gene expression datasets
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差异表达基因浏览器 (DrEdGE)：用于生成基因表达数据集的交互式在线可视化的工具
DOI：
10.1093/bioinformatics/btz972
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发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
5.8
通讯作者：
Wren, ed., Jonathan
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Tintori, Sophia C.;Golden, Patrick;Goldstein, Bob;Wren, ed., Jonathan
Differential Expression Gene Explorer（DrEdGE）是一个基于网络的工具，可以指导基因组学家轻松创建交互式在线数据可视化，同事们可以根据自己的条件进行查询，以发现感兴趣的基因，样本或模式。我们展示了DrEdGE的功能与三个例子网站产生的公开可用的标本-人类神经元组织，小鼠胚胎组织和秀丽隐杆线虫整个胚胎。DrEdGE通过消除独立探索的技术障碍来提高大型基因组学数据集的实用性。可用性和实施可在http://dredge.bio.unc.edu.Supplementary免费获得信息补充数据可在Bioinformatics在线获得。
SummaryDifferential Expression Gene Explorer (DrEdGE) is a web-based tool that guides genomicists through easily creating interactive online data visualizations, which colleagues can query according to their own conditions to discover genes, samples or patterns of interest. We demonstrate DrEdGE’s features with three example websites generated from publicly available datasets—human neuronal tissue, mouse embryonic tissue andCaenorhabditis eleganswhole embryos. DrEdGE increases the utility of large genomics datasets by removing technical obstacles to independent exploration.Availability and implementationFreely available at http://dredge.bio.unc.edu.Supplementary informationSupplementary data are available atBioinformaticsonline.
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