Regulation of the apolipoprotein gene cluster by a long noncoding RNA.
Regulation of the apolipoprotein gene cluster by a long noncoding RNA.
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DOI：
10.1016/j.celrep.2013.12.015
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发表时间：
2014-01-16
期刊：
影响因子：
8.8
通讯作者：
Wahlestedt C
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Halley P;Kadakkuzha BM;Faghihi MA;Magistri M;Zeier Z;Khorkova O;Coito C;Hsiao J;Lawrence M;Wahlestedt C
载脂蛋白A-1(ApoA1)是血浆高密度脂蛋白(HDL)的主要蛋白质组分。我们已经在体内和体外鉴定了一个内源性表达的非编码的天然反义转录本APOA1-AS，它作为APOA1的负转录调节因子。抑制培养细胞中的APOA1-AS导致APOA1和APO簇中两个相邻基因的表达增加。对APOA1基因两侧50Kb染色质区域的染色质免疫沉淀(ChIP)分析表明，APOA1-AS可以通过组蛋白修饰酶的募集来调节不同的组蛋白甲基化模式，这些甲基化模式标志着活跃和/或非活跃的基因表达。使用短反义寡核苷酸靶向APOA1-AS还增强了APOA1在人和猴子肝细胞中的表达，并诱导了非洲绿猴肝脏RNA和蛋白质表达的增加。这里的结果进一步强调了长的非编码反义RNA的显著局部调节作用，并证明了在体外和体内操纵这些转录本的表达的治疗潜力。
Apolipoprotein A-1 (APOA1) is the major protein component of high-density lipoprotein (HDL) in plasma. We have identified an endogenously expressed long non-coding natural antisense transcript, APOA1-AS, which acts as a negative transcriptional regulator of APOA1, both in vitro and in vivo. Inhibition of APOA1-AS in cultured cells resulted in the increased expression of APOA1, and two neighboring genes in the APO cluster. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) analyses of a ~50Kb chromatin region flanking the APOA1 gene demonstrated that APOA1-AS can modulate distinct histone methylation patterns that mark active and/or inactive gene expression, through the recruitment of histone-modifying enzymes. Targeting APOA1-AS using short antisense oligonucleotides also enhanced APOA1 expression in both human and monkey liver cells, and induced an increase in hepatic RNA and protein expression in African green monkeys. The results presented here further highlight the significant local modulatory effects of long non-coding antisense RNAs, and demonstrate the therapeutic potential of manipulating the expression of these transcripts both in vitro and in vivo.
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影响因子：
64.5
作者：
Huarte M;Guttman M;Feldser D;Garber M;Koziol MJ;Kenzelmann-Broz D;Khalil AM;Zuk O;Amit I;Rabani M;Attardi LD;Regev A;Lander ES;Jacks T;Rinn JL
通讯作者：
Rinn JL
影响因子：
4
作者：
Kouzarides, T
通讯作者：
Kouzarides, T
影响因子：
64.5
作者：
Kim, Tae Hoon;Abdullaev, Ziedulla K.;Ren, Bing
通讯作者：
Ren, Bing
DOI：
10.1016/0006-291x(87)90451-7
发表时间：
1987-01-15
影响因子：
3.1
作者：
BARBARAS, R;PUCHOIS, P;AILHAUD, G
通讯作者：
AILHAUD, G
影响因子：
56.9
作者：
Cao, R;Wang, LJ;Zhang, Y
通讯作者：
Zhang, Y