Enhanced neutralization resistance of SARS-CoV-2 Omicron subvariants BQ.1, BQ.1.1, BA.4.6, BF.7, and BA.2.75.2.
Enhanced neutralization resistance of SARS-CoV-2 Omicron subvariants BQ.1, BQ.1.1, BA.4.6, BF.7, and BA.2.75.2.
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DOI：
10.1016/j.chom.2022.11.012
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发表时间：
2023-01-11
影响因子：
30.3
通讯作者：
Liu, Shan-Lu
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Qu, Panke;Evans, John P.;Faraone, Julia N.;Zheng, Yi-Min;Carlin, Claire;Anghelina, Mirela;Stevens, Patrick;Fernandez, Soledad;Jones, Daniel;Lozanski, Gerard;Panchal, Ashish;Saif, Linda J.;Oltz, Eugene M.;Xu, Kai;Gumina, Richard J.;Liu, Shan-Lu
SARS-CoV-2 的持续进化导致了几个新的 Omicron 亚变体的出现，包括 BQ.1、BQ.1.1、BA.4.6、BF.7 和 BA.2.75.2。在这里，我们检查了这些亚变体对接种 3 剂疫苗的医护人员、住院 BA.1 波患者和 BA.4/5 波患者血清的中和抗性。我们发现所有新亚变体的中和抗性均增强，尤其是由 N460K 和 K444T 突变驱动的 BQ.1 和 BQ.1.1 亚变体，以及主要由 F486S 突变驱动的 BA.2.75.2 亚变体。所有 Omicron 亚变体在 Calu-3 细胞中均保持减弱的感染性，F486S 突变导致 BA.2.75.2 亚变体滴度进一步降低。分子模型揭示了 R346T、K444T、F486S 和 D1199N 突变抗体介导的免疫逃避机制。总而言之，这些发现揭示了新出现的 SARS-CoV-2 Omicron 亚变体的进化。继 BA.4/5 和 BA.2.75 亚变体之后，出现了许多 Omicron 亚变体。 Qu 及其同事研究了这些亚变体及其祖先变体的中和抗体抗性。 BQ.1、BQ.1.1、BA.4.6、BF.7 和 BA.2.75.2 表现出增强的中和抗体逃逸，其中 BQ.1/BQ.1.1 和 BA.2.75.2 分别由 N460K/K444T 和 F486S 突变驱动。
The continued evolution of SARS-CoV-2 has led to the emergence of several new Omicron subvariants, including BQ.1, BQ.1.1, BA.4.6, BF.7, and BA.2.75.2. Here, we examine the neutralization resistance of these subvariants against sera from 3-dose vaccinated healthcare workers, hospitalized BA.1-wave patients, and BA.4/5-wave patients. We found enhanced neutralization resistance in all new subvariants, especially in the BQ.1 and BQ.1.1 subvariants driven by N460K and K444T mutations, as well as the BA.2.75.2 subvariant driven largely by its F486S mutation. All Omicron subvariants maintained their weakened infectivity in Calu-3 cells, with the F486S mutation driving further diminished titer for the BA.2.75.2 subvariant. Molecular modeling revealed the mechanisms of antibody-mediated immune evasion by R346T, K444T, F486S, and D1199N mutations. Altogether, these findings shed light on the evolution of newly emerging SARS-CoV-2 Omicron subvariants. Numerous Omicron subvariants have emerged following BA.4/5 and BA.2.75 subvariants. Qu and colleagues investigate the neutralizing antibody resistance of these subvariants and their ancestral variants. BQ.1, BQ.1.1, BA.4.6, BF.7, and BA.2.75.2 exhibit enhanced neutralizing antibody escape, with BQ.1/BQ.1.1 and BA.2.75.2 driven by N460K/K444T and F486S mutations, respectively.
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Qu, Panke;Evans, John P.;Zheng, Yi-Min;Carlin, Claire;Saif, Linda J.;Oltz, Eugene M.;Xu, Kai;Gumina, Richard J.;Liu, Shan-Lu
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Liu, Shan-Lu
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作者：
Plante JA;Liu Y;Liu J;Xia H;Johnson BA;Lokugamage KG;Zhang X;Muruato AE;Zou J;Fontes-Garfias CR;Mirchandani D;Scharton D;Bilello JP;Ku Z;An Z;Kalveram B;Freiberg AN;Menachery VD;Xie X;Plante KS;Weaver SC;Shi PY
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Shi PY