Identifying RNA editing sites using RNA sequencing data alone.
Identifying RNA editing sites using RNA sequencing data alone.
复制标题
DOI：
10.1038/nmeth.2330
复制
发表时间：
2013-02
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Li, Jin Billy
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ramaswami, Gokul;Zhang, Rui;Piskol, Robert;Keegan, Liam P.;Deng, Patricia;O'Connell, Mary A.;Li, Jin Billy
我们表明，可以使用来自个体或物种的多个样本的RNA测序数据以高置信度调用RNA编辑位点，而不需要匹配的基因组DNA序列。我们在人类和果蝇中发现了许多以前未识别的编辑位点;我们的结果几乎是已知的人类蛋白质重新编码事件数量的两倍。我们还发现，在Alu重复序列中含有保守编辑位点的人类基因富含神经元功能。
We show that RNA editing sites can be called with high confidence using RNA sequencing data from multiple samples across either individuals or species, without the need for matched genomic DNA sequence. We identified many previously unidentified editing sites in both humans and Drosophila; our results nearly double the known number of human protein recoding events. We also found that human genes harboring conserved editing sites within Alu repeats are enriched for neuronal functions.
登录
查看更多内容
影响因子：
4.5
作者：
Kleinman, Claudia L.;Adoue, Veronique;Majewski, Jacek
通讯作者：
Majewski, Jacek
DOI：
10.1126/science.1207018
发表时间：
2011-07-01
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Li M;Wang IX;Li Y;Bruzel A;Richards AL;Toung JM;Cheung VG
通讯作者：
Cheung VG
使用下一代 DNA 测序数据进行变异发现和基因分型的框架。
影响因子：
30.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
56.9
作者：
Hoopengardner, B;Bhalla, T;Reenan, R
通讯作者：
Reenan, R
影响因子：
16.6
作者：
Nishikura K
通讯作者：
Nishikura K