resevol: An R package for spatially explicit models of pesticide resistance given evolving pest genomes.
resevol: An R package for spatially explicit models of pesticide resistance given evolving pest genomes.
复制标题
DOI：
10.1371/journal.pcbi.1011691
复制
发表时间：
2023-12
影响因子：
4.3
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
农药耐药性的演变是一个广泛存在的问题，可能对全球粮食安全造成严重后果。我们介绍了resevol R包，它模拟了基于个体的害虫模型，这些模型具有进化的基因组，产生影响害虫生活史和农药抗性的复杂、多基因和共变性状。模拟是在空间明确和高度可定制的景观上进行建模的，其中作物和农药的施用和轮作可能会有所不同，这使该软件包成为害虫管理和抗性进化的一般和战术模型的高度灵活的工具。我们提出了resevol包的主要特点，并演示了它的使用一个简单的例子，模拟害虫的两个共变特征。resevol R包在GNU公共许可证下是开源的。所有源代码和文档都可以在GitHub上获得。
The evolution of pesticide resistance is a widespread problem with potentially severe consequences for global food security. We introduce the resevol R package, which simulates individual-based models of pests with evolving genomes that produce complex, polygenic, and covarying traits affecting pest life history and pesticide resistance. Simulations are modelled on a spatially-explicit and highly customisable landscape in which crop and pesticide application and rotation can vary, making the package a highly flexible tool for both general and tactical models of pest management and resistance evolution. We present the key features of the resevol package and demonstrate its use for a simple example simulating pests with two covarying traits. The resevol R package is open source under GNU Public License. All source code and documentation are available on GitHub.
登录
查看更多内容
影响因子：
2
作者：
Haridas, C., V;Tenhumberg, Brigitte
通讯作者：
Tenhumberg, Brigitte
具有农药抗性和 IPM 策略发展的离散宿主-寄生蜂模型
影响因子：
2.8
作者：
Liang, Juhua;Tang, Sanyi;Cheke, Robert A.
通讯作者：
Cheke, Robert A.
影响因子：
8.8
作者：
Ives, AR;Andow, DA
通讯作者：
Andow, DA
影响因子：
4.1
作者：
Busi R;Neve P;Powles S
通讯作者：
Powles S
影响因子：
16.6
作者：
Bradshaw CJ;Leroy B;Bellard C;Roiz D;Albert C;Fournier A;Barbet-Massin M;Salles JM;Simard F;Courchamp F
通讯作者：
Courchamp F