Engineering Biology: Model Conceptualisation and Realisation

Engineering Biology: Model Conceptualisation and Realisation
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工程生物学:模型概念化和实现

DOI:
10.1177/002029401104400604
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发表时间:
2011
影响因子:
2
通讯作者:
Imms R
Imms R
中科院分区:
计算机科学4区
文献类型:
--
作者:
Imms R

文献摘要

参考文献

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噬菌体-λ病毒的裂解-溶原性决定循环的模型已使用标准工程工具重新实施。该模型基于以前的系统生物学工作,并使用病毒内蛋白质信号网络的生物学知识构建。它探讨了如何从蛋白质的相互作用产生的新兴影响所观察到的裂解溶原性行为。选择使用的软件工具(LabVIEWTM和MATLABTM)是因为它们不需要专业的生物化学知识,并且具有广泛的工业用户基础。该模型是拉夫堡大学法洛项目的一部分,该项目正在制作先天性心脏病的多尺度模型。这项研究的一部分需要一个Delta-Notch蛋白信号转导模型。评论的应用程序上实现的建模技术在细胞中的Delta Notch蛋白信号的建模。
A model of the lysis-lysogeny decision cycle of the Phage-λ virus has been re-implemented using standard engineering tools. The model is based on previous systems biology-based work and is constructed using the biological knowledge of the protein signalling networks within the virus. It explores how the emergent effects from the protein interactions produce the observed lysis-lysogeny behaviour. The software tools used (LabVIEWTM and MATLABTM) were chosen as they do not require specialised biochemical knowledge and have a wide industrial user base. This modelling is done as part of Project Fallot at Loughborough University, which is producing multiscale models of congenital heart disease. Part of this research requires a model of Delta-Notch protein signalling. Comment is made on the applications of the implemented modelling technique for modelling of Delta Notch protein signalling in cells.
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