Integrating DNA methylation dynamics into a framework for understanding epigenetic codes.
Integrating DNA methylation dynamics into a framework for understanding epigenetic codes.
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DOI：
10.1002/bies.201300090
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发表时间：
2014-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Jin P
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Szulwach KE;Jin P
基因组功能由DNA序列和控制遗传信息获取的分子机制的组合决定。可以通过解释影响DNA包装到染色质中的共价修饰来确定对DNA的访问，包括DNA甲基化和组蛋白修饰。这些修饰被认为是以反映细胞表型的可辨别组合存在的“表观遗传密码”的形式。尽管已知DNA甲基化在基因调控和基因组功能中发挥重要作用，但它对表观遗传信息编码的贡献才刚刚开始显现。在这里，我们讨论了与DNA甲基化/去甲基化的各个组成部分相关的范例，以及在理解其在基因组中的动态调节方面的最新进展，将这些机制整合到一个框架中，以解释DNA甲基化如何有助于表观遗传密码。
Genomic function is dictated by a combination of DNA sequence and the molecular mechanisms controlling access to genetic information. Access to DNA can be determined by the interpretation of covalent modifications that influence the packaging of DNA into chromatin, including DNA methylation and histone modifications. These modifications are believed to be forms of “epigenetic codes” that exist in discernable combinations that reflect cellular phenotype. Although DNA methylation is known to play important roles in gene regulation and genomic function, its contribution to the encoding of epigenetic information is just beginning to emerge. Here we discuss paradigms associated with the various components of DNA methylation/demethylation and recent advances in the understanding of its dynamic regulation in the genome, integrating these mechanisms into a framework to explain how DNA methylation could contribute to epigenetic codes.
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影响因子：
48
作者：
Flusberg, Benjamin A.;Webster, Dale R.;Lee, Jessica H.;Travers, Kevin J.;Olivares, Eric C.;Clark, Tyson A.;Korlach, Jonas;Turner, Stephen W.
通讯作者：
Turner, Stephen W.
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16
作者：
Blackledge NP;Zhou JC;Tolstorukov MY;Farcas AM;Park PJ;Klose RJ
通讯作者：
Klose RJ
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作者：
GRUENBAUM, Y;CEDAR, H;RAZIN, A
通讯作者：
RAZIN, A
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作者：
Gifford CA;Ziller MJ;Gu H;Trapnell C;Donaghey J;Tsankov A;Shalek AK;Kelley DR;Shishkin AA;Issner R;Zhang X;Coyne M;Fostel JL;Holmes L;Meldrim J;Guttman M;Epstein C;Park H;Kohlbacher O;Rinn J;Gnirke A;Lander ES;Bernstein BE;Meissner A
通讯作者：
Meissner A
R环的形成是未甲基化的人类CpG岛启动子的独特特征。
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16
作者：
Ginno PA;Lott PL;Christensen HC;Korf I;Chédin F
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Chédin F