Genomic approaches with natural fish populations.
Genomic approaches with natural fish populations.
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DOI：
10.1111/j.1095-8649.2010.02563.x
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发表时间：
2010-04
影响因子：
2
通讯作者：
Oleksiak MF
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Oleksiak MF
自然种群与自交系种群相比，由于自然种群具有更大的多态性，为鉴定核苷酸取代的影响提供了更丰富的资源。此外，自然种群比大多数常见的研究生物具有优势，因为它们受自然选择的影响，对这些适应的分析可以用来识别生物学上重要的变化。在鱼类中，由于有广泛的物种多样性（大约28000种，比任何其他脊椎动物都多），这些分析得到了加强，它们生活在各种各样的环境中（从冰点以下到> 46°C，从淡水到盐度> 40 ppt）。此外，鱼类表现出许多不同的生活史和繁殖策略，并具有许多不同的表型和社会结构。虽然鱼类提供了许多优于其他脊椎动物模型的优势，但仍然缺乏可用的鱼类基因组工具。鱼类约占所有已知脊椎动物物种的一半，但只有不到0.2%的鱼类具有重要的基因组资源。尽管如此，对鱼类的基因组方法已经提供了一些基因表达个体差异的初步测量，并对环境和生态适应有了深入的了解。因此，使用天然鱼类种群的基因组方法有可能彻底改变各种鱼类的基础研究，从而提供无数的生态和进化问题。
Natural populations versus inbred stocks provide a much richer resource for identifying the effects of nucleotide substitutions because natural populations have greater polymorphism. Additionally, natural populations offer an advantage over most common research organisms because they are subject to natural selection, and analyses of these adaptations can be used to identify biologically important changes. Among fishes, these analyses are enhanced by having a wide diversity of species (> 28,000 species, more than any other group of vertebrates) living in a huge range of environments (from below freezing to > 46° C, in fresh water to salinities > 40 ppt.). Moreover, fishes exhibit many different life history and reproductive strategies and have many different phenotypes and social structures. While fishes provide numerous advantages over other vertebrate models, there is still a dearth of available genomic tools for fishes. Fish make up approximately half of all known vertebrate species, yet less than 0.2% of fish species have significant genomic resources. Nonetheless, genomic approaches with fishes have provided some of the first measures of individual variation in gene expression and insights in to environmental and ecological adaptations. Thus, genomic approaches with natural fish populations have the potential to revolutionize fundamental studies of diverse fish species that offer myriad ecological and evolutionary questions.
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DOI：
10.1016/j.cbpc.2008.11.005
发表时间：
2009-03-01
影响因子：
3.9
作者：
Boswell, Mikki G.;Wells, Melissa C.;Walter, Ronald B.
通讯作者：
Walter, Ronald B.
DOI：
10.1111/j.1095-8312.1999.tb01165.x
发表时间：
1999-09-01
影响因子：
1.9
作者：
Bernatchez, L;Chouinard, A;Lu, GQ
通讯作者：
Lu, GQ
影响因子：
30.8
作者：
Ayroles, Julien F.;Carbone, Mary Anna;Stone, Eric A.;Jordan, Katherine W.;Lyman, Richard F.;Magwire, Michael M.;Rollmann, Stephanie M.;Duncan, Laura H.;Lawrence, Faye;Anholt, Robert R. H.;Mackay, Trudy F. C.
通讯作者：
Mackay, Trudy F. C.
DOI：
10.1073/pnas.0802432105
发表时间：
2008-09-02
影响因子：
11.1
作者：
Chen, Zuozhou;Cheng, C. -H. Christina;Chen, Liangbiao
通讯作者：
Chen, Liangbiao
影响因子：
2
作者：
Conover, D. O.;Clarke, L. M.;Wagner, G. N.
通讯作者：
Wagner, G. N.