RNA-dependent chromatin targeting of TET2 for endogenous retrovirus control in pluripotent stem cells.
RNA-dependent chromatin targeting of TET2 for endogenous retrovirus control in pluripotent stem cells.
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DOI：
10.1038/s41588-018-0060-9
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发表时间：
2018-03
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Wang J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Guallar D;Bi X;Pardavila JA;Huang X;Saenz C;Shi X;Zhou H;Faiola F;Ding J;Haruehanroengra P;Yang F;Li D;Sanchez-Priego C;Saunders A;Pan F;Valdes VJ;Kelley K;Blanco MG;Chen L;Wang H;Sheng J;Xu M;Fidalgo M;Shen X;Wang J
Tet蛋白通过氧化甲基胞嘧啶(5mC)产生5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)，既可作为稳定的表观遗传标记，又可参与主动去甲基化，在调节DNA甲基化状态中起着关键作用。与其他Tet家族成员不同，TET2不包含DNA结合域，目前尚不清楚它是如何被招募到染色质的。在这里，我们发现TET2是由RNA结合蛋白Paraspeckle Component 1(PSPC1)通过转录活性位点招募的，包括内源性逆转录病毒(ERV)，其长末端重复序列(LTRs)已被哺乳动物基因组选为阶段和组织特异性转录调节模块。我们发现PSPC1和TET2通过组蛋白脱乙酰基酶转录抑制和通过5hmC修饰转录后RNA失稳来参与ERVL和ERVL相关基因的调控。我们的发现为转录活性ERV作为RNA表观遗传调控和基因调控的特定对接位点的功能作用提供了证据。
Ten-eleven translocation (TET) proteins play key roles in regulating the methylation status of DNA through oxidizing methylcytosines (5mC), generating 5-hydroxymethylcytosines (5hmC) that can both serve as stable epigenetic marks and participate in active demethylation. Unlike the other TET-family members, TET2 does not contain a DNA-binding domain, and it remains unclear how it is recruited to chromatin. Here we show that TET2 is recruited by the RNA-binding protein Paraspeckle component 1 (PSPC1) through transcriptionally active loci, including endogenous retroviruses (ERVs) whose long terminal repeats (LTRs) have been co-opted by mammalian genomes as stage- and tissue-specific transcriptional regulatory modules. We find that PSPC1 and TET2 contribute to ERVL and ERVL-associated gene regulation by both transcriptional repression via histone deacetylases and posttranscriptional destabilization of RNAs through 5hmC modification. Our findings provide evidence for a functional role of transcriptionally active ERVs as specific docking sites for RNA epigenetic modulation and gene regulation.
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DOI：
10.1126/science.aag1927
发表时间：
2017-02-10
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Choi YJ;Lin CP;Risso D;Chen S;Kim TA;Tan MH;Li JB;Wu Y;Chen C;Xuan Z;Macfarlan T;Peng W;Lloyd KC;Kim SY;Speed TP;He L
通讯作者：
He L
影响因子：
12.3
作者：
Amort T;Rieder D;Wille A;Khokhlova-Cubberley D;Riml C;Trixl L;Jia XY;Micura R;Lusser A
通讯作者：
Lusser A
影响因子：
4.4
作者：
Cao S;Han J;Wu J;Li Q;Liu S;Zhang W;Pei Y;Ruan X;Liu Z;Wang X;Lim B;Li N
通讯作者：
Li N
DOI：
10.1126/science.aad5497
发表时间：
2016-03-04
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Chuong EB;Elde NC;Feschotte C
通讯作者：
Feschotte C
影响因子：
7.2
作者：
Fox, Archa H.;Lamond, Angus I.
通讯作者：
Lamond, Angus I.