Global epigenomic reconfiguration during mammalian brain development.
Global epigenomic reconfiguration during mammalian brain development.
复制标题
哺乳动物大脑发育过程中的全球表观基因组重新配置。
DOI：
10.1126/science.1237905
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发表时间：
2013-08-09
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Ecker JR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lister R;Mukamel EA;Nery JR;Urich M;Puddifoot CA;Johnson ND;Lucero J;Huang Y;Dwork AJ;Schultz MD;Yu M;Tonti-Filippini J;Heyn H;Hu S;Wu JC;Rao A;Esteller M;He C;Haghighi FG;Sejnowski TJ;Behrens MM;Ecker JR
DNA 甲基化与哺乳动物大脑发育以及学习和记忆的可塑性有关。我们以单碱基分辨率报告了人类和小鼠额叶皮层整个生命周期的全基因组组成、模式、细胞特异性和 DNA 甲基化动态。广泛的甲基化重组发生在胎儿到年轻人的发育过程中，与突触发生同时发生。在此期间，高度保守的非CG甲基化（mCH）在神经元而非神经胶质细胞中积累，成为人类神经元基因组中甲基化的主要形式。此外，我们发现了一个 mCH 特征，可以识别逃避 X 染色体失活的基因。最后，全基因组单碱基分辨率 5-羟甲基胞嘧啶 (hmC) 图谱显示，hmC 在假定的调节区域标记胎儿脑细胞基因组，这些调节区域在成人大脑中被 CG 去甲基化并激活，并且这些 hmC 平衡位点的 CG 去甲基化取决于 Tet2 活性。
DNA methylation is implicated in mammalian brain development and plasticity underlying learning and memory. We report the genome-wide composition, patterning, cell specificity, and dynamics of DNA methylation at single-base resolution in human and mouse frontal cortex throughout their lifespan. Widespread methylome reconfiguration occurs during fetal to young adult development, coincident with synaptogenesis. During this period, highly conserved non-CG methylation (mCH) accumulates in neurons, but not glia, to become the dominant form of methylation in the human neuronal genome. Moreover, we found an mCH signature that identifies genes escaping X-chromosome inactivation. Last, whole-genome single-base resolution 5-hydroxymethylcytosine (hmC) maps revealed that hmC marks fetal brain cell genomes at putative regulatory regions that are CG-demethylated and activated in the adult brain and that CG demethylation at these hmC-poised loci depends on Tet2 activity.
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影响因子：
3.7
作者：
Globisch D;Münzel M;Müller M;Michalakis S;Wagner M;Koch S;Brückl T;Biel M;Carell T
通讯作者：
Carell T
Dnmt1 和 Dnmt3a 维持 DNA 甲基化并调节成人前脑神经元的突触功能
影响因子：
25
作者：
Feng, Jian;Zhou, Yu;Campbell, Susan L.;Le, Thuc;Li, En;Sweatt, J. David;Silva, Alcino J.;Fan, Guoping
通讯作者：
Fan, Guoping
DOI：
10.1073/pnas.1121251109
发表时间：
2012-10-16
影响因子：
11.1
作者：
Kolb, Bryan;Mychasiuk, Richelle;Gibb, Robbin
通讯作者：
Gibb, Robbin
影响因子：
64.5
作者：
Guo JU;Su Y;Zhong C;Ming GL;Song H
通讯作者：
Song H
影响因子：
4.8
作者：
Levenson, Jonathan M.;Roth, Tania L.;Sweatt, J. David
通讯作者：
Sweatt, J. David