Identification of the gene-regulatory landscape in skeletal development and potential links to skeletal regeneration.
Identification of the gene-regulatory landscape in skeletal development and potential links to skeletal regeneration.
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DOI：
10.1016/j.reth.2017.04.001
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发表时间：
2017-06
影响因子：
4.3
通讯作者：
Ohba S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hojo H;Chung UI;Ohba S
一类称为增强子的基因调控元件是控制基因表达的定量、时间和空间的主要介质。在进化过程中，哺乳动物等高等生物的增强子景观变得相当复杂，精确而协调地发挥着生物学功能。在哺乳动物骨骼发育中，主要转录因子Sox 9、Runx 2和Sp 7/Osterix主要通过基因组上的增强子发挥功能，以实现骨骼细胞的特化和分化。最近开发的基因组规模的分析揭示了多层次的基因调控，不仅揭示了这些转录因子对骨骼增强子的主要作用模式，而且还揭示了表观遗传景观与三维染色质结构的关系。在这里，我们审查的新框架的基因调控网络参与骨骼发育的研究结果。我们进一步讨论了基因组规模分析的力量，为骨骼组织中的遗传疾病和再生医学提供了新的见解。骨骼肌的发育是由主转录因子协调的。骨骼调节剂的ChIP-seq分析确定了它们的作用模式。骨骼组织中表观遗传景观特征不同细胞类型的分析。基因调控网络的综合分析与骨骼再生有关。
A class of gene-regulatory elements called enhancers are the main mediators controlling quantitative, temporal and spatial gene expressions. In the course of evolution, the enhancer landscape of higher organisms such as mammals has become quite complex, exerting biological functions precisely and coordinately. In mammalian skeletal development, the master transcription factors Sox9, Runx2 and Sp7/Osterix function primarily through enhancers on the genome to achieve specification and differentiation of skeletal cells. Recently developed genome-scale analyses have shed light on multiple layers of gene regulations, uncovering not only the primary mode of actions of these transcription factors on skeletal enhancers, but also the relation of the epigenetic landscape to three-dimensional chromatin architecture. Here, we review findings on the emerging framework of gene-regulatory networks involved in skeletal development. We further discuss the power of genome-scale analyses to provide new insights into genetic diseases and regenerative medicine in skeletal tissues. Skeletal development is coordinated by master transcription factors. ChIP-seq analyses for the skeletal regulators identified their modes of actions. Analyses of epigenetic landscape features distinct cell types in skeletal tissues. Integrated analyses of the gene regulatory networks link to skeletal regeneration.
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影响因子：
16
作者：
Calo, Eliezer;Wysocka, Joanna
通讯作者：
Wysocka, Joanna
影响因子：
10.5
作者：
Akiyama, H;Chaboissier, MC;de Crombrugghe, B
通讯作者：
de Crombrugghe, B
DOI：
10.1073/pnas.0504750102
发表时间：
2005-10-11
影响因子：
11.1
作者：
Akiyama, H;Kim, JE;de Crombrugghe, B
通讯作者：
de Crombrugghe, B
单细胞染色质可及性揭示了调节变化的原理。
影响因子：
64.8
作者：
Buenrostro JD;Wu B;Litzenburger UM;Ruff D;Gonzales ML;Snyder MP;Chang HY;Greenleaf WJ
通讯作者：
Greenleaf WJ
影响因子：
4.1
作者：
Berendsen AD;Olsen BR
通讯作者：
Olsen BR