ACME dissociation: a versatile cell fixation-dissociation method for single-cell transcriptomics
ACME dissociation: a versatile cell fixation-dissociation method for single-cell transcriptomics
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ACME 解离：一种用于单细胞转录组学的多功能细胞固定-解离方法
DOI：
10.1101/2020.05.26.117234
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发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
García-Castro H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
García-Castro H
单细胞测序技术正在彻底改变生物学，但它们受到需要解离活样品的限制。在这里，我们提出了ACME（醋酸-甲醇），一种同时固定细胞的单细胞转录组学解离方法。ACME解离的细胞具有高RNA完整性，可以多次冷冻保存，并且是可分选的和可渗透的。作为原理的证明，我们使用基于液滴和组合条形码单细胞方法提供不同物种的单细胞转录组数据。ACME使用价格实惠的试剂，可以在大多数实验室甚至在现场完成，因此将加速我们对生命之树中细胞类型的了解。
Single-cell sequencing technologies are revolutionizing biology, but they are limited by the need to dissociate live samples. Here, we present ACME (ACetic-MEthanol), a dissociation approach for single-cell transcriptomics that simultaneously fixes cells. ACME-dissociated cells have high RNA integrity, can be cryopreserved multiple times, and are sortable and permeable. As a proof of principle, we provide single-cell transcriptomic data of different species, using both droplet-based and combinatorial barcoding single-cell methods. ACME uses affordable reagents, can be done in most laboratories and even in the field, and thus will accelerate our knowledge of cell types across the tree of life.
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影响因子：
64.8
作者：
Cao, Junyue;Spielmann, Malte;Shendure, Jay
通讯作者：
Shendure, Jay
影响因子：
64.5
作者：
Davie K;Janssens J;Koldere D;De Waegeneer M;Pech U;Kreft Ł;Aibar S;Makhzami S;Christiaens V;Bravo González-Blas C;Poovathingal S;Hulselmans G;Spanier KI;Moerman T;Vanspauwen B;Geurs S;Voet T;Lammertyn J;Thienpont B;Liu S;Konstantinides N;Fiers M;Verstreken P;Aerts S
通讯作者：
Aerts S
影响因子：
64.5
作者：
Tim Stuart;Andrew Butler;Paul J. Hoffman;Christoph Hafemeister;Efthymia Papalexi;William M. Mauck;
通讯作者：
Tim Stuart;Andrew Butler;Paul J. Hoffman;Christoph Hafemeister;Efthymia Papalexi;William M. Mauck;
DOI：
10.1126/science.aaq0681
发表时间：
2018-10-26
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Gerber T;Murawala P;Knapp D;Masselink W;Schuez M;Hermann S;Gac-Santel M;Nowoshilow S;Kageyama J;Khattak S;Currie JD;Camp JG;Tanaka EM;Treutlein B
通讯作者：
Treutlein B
广泛的基因重复促进了肌肉细胞类型多样化
DOI：
--
发表时间：
2020
期刊：
bioRxiv
影响因子：
--
作者：
A. Cole;Sabrina Kaul;Stefan M. Jahnel;Julia Steger;Bob Zimmerman;R. Reischl;G. Richards;Fabian Rentzsch;Patrick R. H. Steinmetz;U. Technau
通讯作者：
U. Technau