Archiving next generation sequencing data.
Archiving next generation sequencing data.
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DOI：
10.1093/nar/gkp1078
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发表时间：
2010-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Sugawara H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Shumway M;Cochrane G;Sugawara H
下一代测序平台正在以前所未有的数量产生生物测序数据。国际核苷酸测序数据库合作的合作伙伴，包括国家生物技术信息中心（NCBI），欧洲生物信息学研究所（EBI）和日本DNA数据库（DDBJ），已经建立了序列读取档案（SRA），为科学界提供下一代数据集的存档目的地。SRA现在可在NCBI的http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra、EBI的http://www.ebi.ac.uk/ena和DDBJ的http://www.ddbj.nig.ac.jp/sub/trace_sra-e.html上访问。这些资源的用户可以获得存放在三个SRA实例中任何一个中的数据集。提供链接和提交说明。
Next generation sequencing platforms are producing biological sequencing data in unprecedented amounts. The partners of the International Nucleotide Sequencing Database Collaboration, which includes the National Center for Biotechnology Information (NCBI), the European Bioinformatics Institute (EBI), and the DNA Data Bank of Japan (DDBJ), have established the Sequence Read Archive (SRA) to provide the scientific community with an archival destination for next generation data sets. The SRA is now accessible at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra from NCBI, at http://www.ebi.ac.uk/ena from EBI and at http://www.ddbj.nig.ac.jp/sub/trace_sra-e.html from DDBJ. Users of these resources can obtain data sets deposited in any of the three SRA instances. Links and submission instructions are provided.
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影响因子：
14.9
作者：
Wheeler, David L.;Barrett, Tanya;Yaschenko, Eugene
通讯作者：
Yaschenko, Eugene
影响因子：
14.9
作者：
Sugawara H;Ikeo K;Fukuchi S;Gojobori T;Tateno Y
通讯作者：
Tateno Y
影响因子：
14.9
作者：
Wheeler, David L.;Barrett, Tanya;Benson, Dennis A.;Bryant, Stephen H.;Canese, Kathi;Chetvernin, Vyacheslav;Church, Deanna M.;DiCuccio, Michael;Edgar, Ron;Federhen, Scott;Feolo, Michael;Geer, Lewis Y.;Helmberg, Wolfgang;Kapustin, Yuri;Khovayko, Oleg;Landsman, David;Lipman, David J.;Madden, Thomas L.;Maglott, Donna R.;Miller, Vadim;Ostell, James;Pruitt, Kim D.;Schuler, Gregory D.;Shumway, Martin;Sequeira, Edwin;Sherry, Steven T.;Sirotkin, Karl;Souvorov, Alexandre;Starchenko, Grigory;Tatusov, Roman L.;Tatusova, Tatiana A.;Wagner, Lukas;Yaschenko, Eugene
通讯作者：
Yaschenko, Eugene
影响因子：
14.9
作者：
Cochrane G;Akhtar R;Bonfield J;Bower L;Demiralp F;Faruque N;Gibson R;Hoad G;Hubbard T;Hunter C;Jang M;Juhos S;Leinonen R;Leonard S;Lin Q;Lopez R;Lorenc D;McWilliam H;Mukherjee G;Plaister S;Radhakrishnan R;Robinson S;Sobhany S;Hoopen PT;Vaughan R;Zalunin V;Birney E
通讯作者：
Birney E
影响因子：
14.9
作者：
Sayers EW;Barrett T;Benson DA;Bryant SH;Canese K;Chetvernin V;Church DM;DiCuccio M;Edgar R;Federhen S;Feolo M;Geer LY;Helmberg W;Kapustin Y;Landsman D;Lipman DJ;Madden TL;Maglott DR;Miller V;Mizrachi I;Ostell J;Pruitt KD;Schuler GD;Sequeira E;Sherry ST;Shumway M;Sirotkin K;Souvorov A;Starchenko G;Tatusova TA;Wagner L;Yaschenko E;Ye J
通讯作者：
Ye J