DDBJ dealing with mass data produced by the second generation sequencer.
DDBJ dealing with mass data produced by the second generation sequencer.
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DOI：
10.1093/nar/gkn724
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发表时间：
2009-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Tateno Y
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Sugawara H;Ikeo K;Fukuchi S;Gojobori T;Tateno Y
日本DNA数据库（DDBJ）（http://www.ddbj.nig.ac.ac.jp）收集并发布了2007年7月至2008年6月的2 368 110条目或1 415 106 598基地。周期包括Bombyx Mori，Oryzas latipes，果蝇和莲花Japonicus的基因组量表数据。此外，从今年开始，我们与国家生物技术信息中心（NCBI）收集并发布了跟踪档案数据。第一个版本包含人类肠道中的O. latipes和细菌元基因组。为了应对测序技术的当前进展，我们还接受并发布了超过1亿个对寄生原生动物及其宿主的简短读物，这些读物是使用Solexa Sequencer产生的。
DNA Data Bank of Japan (DDBJ) (http://www.ddbj.nig.ac.jp) collected and released 2 368 110 entries or 1 415 106 598 bases in the period from July 2007 to June 2008. The releases in this period include genome scale data of Bombyx mori, Oryzas latipes, Drosophila and Lotus japonicus. In addition, from this year we collected and released trace archive data in collaboration with National Center for Biotechnology Information (NCBI). The first release contains those of O. latipes and bacterial meta genomes in human gut. To cope with the current progress of sequencing technology, we also accepted and released more than 100 million of short reads of parasitic protozoa and their hosts that were produced by using a Solexa sequencer.
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DOI：
10.1093/dnares/dsn008
发表时间：
2008-08
期刊：
DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
影响因子：
--
作者：
Sato S;Nakamura Y;Kaneko T;Asamizu E;Kato T;Nakao M;Sasamoto S;Watanabe A;Ono A;Kawashima K;Fujishiro T;Katoh M;Kohara M;Kishida Y;Minami C;Nakayama S;Nakazaki N;Shimizu Y;Shinpo S;Takahashi C;Wada T;Yamada M;Ohmido N;Hayashi M;Fukui K;Baba T;Nakamichi T;Mori H;Tabata S
通讯作者：
Tabata S
影响因子：
56.9
作者：
Alonso, JM;Stepanova, AN;Ecker, JR
通讯作者：
Ecker, JR
影响因子：
64.8
作者：
Wheeler, David A.;Srinivasan, Maithreyan;Rothberg, Jonathan M.
通讯作者：
Rothberg, Jonathan M.
比较宏基因组学揭示了人肠道微生物组中通常富集的基因集。
影响因子：
4.1
作者：
Kurokawa, Ken;Itoh, Takehiko;Kuwahara, Tomomi;Oshima, Kenshiro;Toh, Hidehiro;Toyoda, Atsushi;Takami, Hideto;Morita, Hidetoshi;Sharma, Vineet K.;Srivastava, Tulika P.;Taylor, Todd D.;Noguchi, Hideki;Mori, Hiroshi;Ogura, Yoshitoshi;Ehrlich, Dusko S.;Itoh, Kikuji;Takagi, Toshihisa;Sakaki, Yoshiyuki;Hayashi, Tetsuya;Hattori, Masahira
通讯作者：
Hattori, Masahira
影响因子：
9.8
作者：
Levy S;Sutton G;Ng PC;Feuk L;Halpern AL;Walenz BP;Axelrod N;Huang J;Kirkness EF;Denisov G;Lin Y;MacDonald JR;Pang AW;Shago M;Stockwell TB;Tsiamouri A;Bafna V;Bansal V;Kravitz SA;Busam DA;Beeson KY;McIntosh TC;Remington KA;Abril JF;Gill J;Borman J;Rogers YH;Frazier ME;Scherer SW;Strausberg RL;Venter JC
通讯作者：
Venter JC