The Rosa genome provides new insights into the domestication of modern roses.
The Rosa genome provides new insights into the domestication of modern roses.
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DOI：
10.1038/s41588-018-0110-3
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发表时间：
2018-06
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Bendahmane M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Raymond O;Gouzy J;Just J;Badouin H;Verdenaud M;Lemainque A;Vergne P;Moja S;Choisne N;Pont C;Carrère S;Caissard JC;Couloux A;Cottret L;Aury JM;Szécsi J;Latrasse D;Madoui MA;François L;Fu X;Yang SH;Dubois A;Piola F;Larrieu A;Perez M;Labadie K;Perrier L;Govetto B;Labrousse Y;Villand P;Bardoux C;Boltz V;Lopez-Roques C;Heitzler P;Vernoux T;Vandenbussche M;Quesneville H;Boualem A;Bendahmane A;Liu C;Le Bris M;Salse J;Baudino S;Benhamed M;Wincker P;Bendahmane M
玫瑰作为观赏植物和香水工业具有很高的文化和经济重要性。我们报道了月季的全基因组测序以及对促成月季驯化的主要基因类型的组装和重新测序。我们从杂合的二倍体现代月季祖先月季‘老红’中产生了一个纯合子基因。使用单分子实时测序和元组装方法，我们获得了迄今为止最完整的植物基因组之一。多样性分析突出了‘La France’的马赛克起源，它是第一批结合了欧洲物种的生长活力和中国物种的经常性开花的杂交品种之一。中国祖先的基因组片段揭示了轮回开花的新候选基因。重建调节和次生代谢途径使我们能够提出一个气味和花色相互关联的调节模型。该基因组为了解月季性状的调控机制提供了基础，并将加速月季、蔷薇科和观赏植物的改良。
Roses hold high cultural and economic importance as ornamentals and for the perfume industry. We report the rose whole genome sequencing and assembly and resequencing of major genotypes that contributed to rose domestication. We generated a homozygous genotype from a heterozygous diploid modern roses progenitor, Rosa chinensis ‘Old Blush’. Using Single Molecule Real-Time sequencing and a meta-assembly approach we obtained one of the most complete plant genomes to date. Diversity analyses highlighted the mosaic origin of ‘La France’, one of the first hybrids combining the growth vigor of European species and recurrent blooming of Chinese species. Genomic segments of Chinese ancestry revealed new candidate genes for recurrent blooming. Reconstructing regulatory and secondary metabolism pathways allowed us to propose a model of interconnected regulation of scent and flower color. This genome provides a foundation for understanding the mechanisms governing rose traits and will accelerate improvement in roses, Rosaceae and ornamentals.
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影响因子：
12.3
作者：
Akdemir KC;Chin L
通讯作者：
Chin L
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3
作者：
Dai X;Sinharoy S;Udvardi M;Zhao PX
通讯作者：
Zhao PX
影响因子：
48
作者：
Chin, Chen-Shan;Peluso, Paul;Schatz, Michael C.
通讯作者：
Schatz, Michael C.
DOI：
10.1073/pnas.1600558113
发表时间：
2016-04-12
影响因子：
11.1
作者：
Huo, Heqiang;Wei, Shouhui;Bradford, Kent J.
通讯作者：
Bradford, Kent J.
影响因子：
3.7
作者：
Hoede C;Arnoux S;Moisset M;Chaumier T;Inizan O;Jamilloux V;Quesneville H
通讯作者：
Quesneville H