genoPlotR: comparative gene and genome visualization in R.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btq413
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发表时间：
2010-09-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Andersson SG
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Guy L;Kultima JR;Andersson SG
摘要：通过下一代测序技术获得的基因和基因组数据量产生了对比较可视化工具的需求。作为对现有基因组数据比较和探索软件的补充，genoPlotR以高度自动化、灵活和可重复的方式自动创建基因和基因组的出版级线性图谱。可用性：genoPlotR是一个独立于平台的R软件包，可在R-Forge获得GPL 2许可证下的完整源代码：http://genoplotr.r-forge.r-project.org/联系人：莱昂内尔. ebc.uu.se
Summary: The amount of gene and genome data obtained by next-generation sequencing technologies generates a need for comparative visualization tools. Complementing existing software for comparison and exploration of genomics data, genoPlotR automatically creates publication-grade linear maps of gene and genomes, in a highly automatic, flexible and reproducible way. Availability: genoPlotR is a platform-independent R package, available with full source code under a GPL2 license at R-Forge: http://genoplotr.r-forge.r-project.org/ Contact: lionel.guy@ebc.uu.se
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