The UCSC Genome Browser database: update 2010.
The UCSC Genome Browser database: update 2010.
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UCSC基因组浏览器数据库：更新2010。
DOI：
10.1093/nar/gkp939
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发表时间：
2010-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kent WJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Rhead B;Karolchik D;Kuhn RM;Hinrichs AS;Zweig AS;Fujita PA;Diekhans M;Smith KE;Rosenbloom KR;Raney BJ;Pohl A;Pheasant M;Meyer LR;Learned K;Hsu F;Hillman-Jackson J;Harte RA;Giardine B;Dreszer TR;Clawson H;Barber GP;Haussler D;Kent WJ
加利福尼亚大学圣克鲁兹分校（UCSC）基因组浏览器网站（http://genome.ucsc.edu/）提供了一个大型的公共可用序列及注释数据数据库，同时还配备了一套集成工具，用于检查和比较生物的基因组、将序列与基因组进行比对，以及展示和共享用户自己的注释数据。截至2009年9月，该网站为47种生物提供了基因组序列和一组基本的注释“轨道”，其中包括14种哺乳动物、10种非哺乳类脊椎动物、3种无脊椎后口动物、13种昆虫、6种蠕虫和一种酵母。今年的新数据亮点包括更新后的人类基因组浏览器、一个44个物种的多序列比对轨道、改进的变异和表型轨道以及16个新的全基因组ENCODE轨道。新功能包括拖放和缩放导航、一个用于用户添加注释的维基轨道、针对大型数据集的新的自定义轨道格式（bigBed和bigWig）、一个新的多重比对输出工具、与变异和蛋白质结构工具的链接、计算机模拟PCR实用程序的增强，以及改进的轨道配置工具。
The University of California, Santa Cruz (UCSC) Genome Browser website (http://genome.ucsc.edu/) provides a large database of publicly available sequence and annotation data along with an integrated tool set for examining and comparing the genomes of organisms, aligning sequence to genomes, and displaying and sharing users’ own annotation data. As of September 2009, genomic sequence and a basic set of annotation ‘tracks’ are provided for 47 organisms, including 14 mammals, 10 non-mammal vertebrates, 3 invertebrate deuterostomes, 13 insects, 6 worms and a yeast. New data highlights this year include an updated human genome browser, a 44-species multiple sequence alignment track, improved variation and phenotype tracks and 16 new genome-wide ENCODE tracks. New features include drag-and-zoom navigation, a Wiki track for user-added annotations, new custom track formats for large datasets (bigBed and bigWig), a new multiple alignment output tool, links to variation and protein structure tools, in silico PCR utility enhancements, and improved track configuration tools.
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作者：
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UniProt Consortium
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