Complete mitochondrial genome of Allognosta vagans (Diptera, Stratiomyidae).
Complete mitochondrial genome of Allognosta vagans (Diptera, Stratiomyidae).
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DOI：
10.1080/23802359.2017.1357450
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发表时间：
2017-07-26
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Yang D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhou Q;Ding S;Li X;Zhang T;Yang D
本研究报道了异种动物（allonosta vagans, low, 1873）线粒体全基因组（mitogenome）。这是Beridinae亚科的第一个有丝分裂基因组测序。基因组全长15982 bp，包括13个蛋白质编码基因、2个核糖体rna、22个转移rna和AT-rich区域的部分序列，AT-rich区域包含多个特征重复序列。编码区核苷酸组成为A的38.8%，T的38.7%，C的9.4%，G的13.1%，A + T的77.5%。到目前为止，我们实验室获得了5个相关物种的完整线粒体基因组数据，所有数据都用于最大似然分析和邻居连接分析。结果支持木蝇科与层蝇科为姐妹类群。
The complete mitochondrial genome (mitogenome) of Allognosta vagans (Loew, 1873) has been reported in this study. This is the first sequenced mitogenome of the subfamily Beridinae. The genome is 15,982 bp in length, including 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNAs, 22 transfer RNAs, and a partial sequence of the AT-rich region, and the AT-rich region contains several characteristic repeated sequences. In addition, the nucleotide composition of the coding region was 38.8% of A, 38.7% of T, 9.4% of C, 13.1% of G, 77.5% of A + T content. So far, five complete mitochondrial genome data of related species are available in our lab, all of them are used in Maximum Likelihood and Neighbour-Join analyses. The result supported that Xylomyidae and Stratiomyidae are sister group.
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