Draft genome sequences for ten strains of Xanthomonas species that have phylogenomic importance
Draft genome sequences for ten strains of Xanthomonas species that have phylogenomic importance
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具有系统发育重要性的十种黄单胞菌属物种的基因组序列草案
DOI：
10.1099/acmi.0.000532.v1
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发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Harrison J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Harrison J
在这里，我们报告了8个植物致病细菌致病变种：野油菜黄单胞菌PV的致病类型菌株的草稿质量的基因组序列。Asclepiadis、野油菜X.campestris pv.Canae，野油菜X.campestris PV.Esculenti、野油菜X.campestris pv.Nigromaculans、野油菜X.campestris PV.Parthenii、野油菜X.campestris PV.Phormiicola，野油菜X.campestris PV.Zinniae和大叶蜂X.dyi pv.桉树(X.campestris pv.)桉树)。我们还对甜瓜X.melonis模式菌株和未分类的Xanthomonas菌株NCPPB 1067进行了测序。这些数据将有助于系统发育学和分类学的研究，填补了Xanthomonas系统发育多样性序列覆盖的一些重要空白。我们包括以前序列不足的路径变种和物种水平分支的代表。此外，这些基因组序列可能有助于阐明重要表型的分子基础，如冠状病毒相关毒素的生物合成和真菌毒素尾孢菌素的降解。
Here we report draft-quality genome sequences for pathotype strains of eight plant-pathogenic bacterial pathovars: Xanthomonas campestris pv. asclepiadis, X. campestris pv. cannae, X. campestris pv. esculenti, X. campestris pv. nigromaculans, X. campestris pv. parthenii, X. campestris pv. phormiicola, X. campestris pv. zinniae and X. dyei pv. eucalypti (= X. campestris pv. eucalypti). We also sequenced the type strain of species X. melonis and the unclassified Xanthomonas strain NCPPB 1067. These data will be useful for phylogenomic and taxonomic studies, filling some important gaps in sequence coverage of Xanthomonas phylogenetic diversity. We include representatives of previously under-sequenced pathovars and species-level clades. Furthermore, these genome sequences may be useful in elucidating the molecular basis for important phenotypes, such as biosynthesis of coronatine-related toxins and degradation of fungal toxin cercosporin.
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影响因子：
3.7
作者：
Walker BJ;Abeel T;Shea T;Priest M;Abouelliel A;Sakthikumar S;Cuomo CA;Zeng Q;Wortman J;Young SK;Earl AM
通讯作者：
Earl AM
DOI：
10.1099/ijsem.0.002189
发表时间：
2017
影响因子：
2.8
作者：
J. Vicente;Steve D. Rothwell;E. Holub;D. Studholme
通讯作者：
D. Studholme
DOI：
10.1099/ijsem.0.005163
发表时间：
2021
影响因子：
2.8
作者：
Nay C. Dia;J. Van Vaerenbergh;C. Van Malderghem;J. Blom;T. H. Smits;B. Cottyn;J. Pothier
通讯作者：
J. Pothier
DOI：
--
发表时间：
1995
期刊：
影响因子：
--
作者：
P. Flynn;A. Vidaver
通讯作者：
A. Vidaver
氧化还原酶参与野油菜黄单胞菌 pv. 细菌对尾孢菌素的降解。
影响因子：
4.4
作者：
Tanya. Taylor;T. Mitchell;M. E. Daub
通讯作者：
M. E. Daub