Retrospective Spatio-Temporal Dynamics of Dengue Virus 1, 2 and 4 in Paraguay.
Retrospective Spatio-Temporal Dynamics of Dengue Virus 1, 2 and 4 in Paraguay.
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DOI：
10.3390/v15061275
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发表时间：
2023-05-30
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Giovanetti M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Vazquez C;Alcantara LCJ;Fonseca V;Lima M;Xavier J;Adelino T;Fritsch H;Castro E;de Oliveira C;Schuab G;Lima ARJ;Villalba S;Gomez de la Fuente A;Rojas A;Cantero C;Fleitas F;Aquino C;Ojeda A;Sequera G;Torales J;Barrios J;Elias MC;Iani FCM;Ortega MJ;Gamarra ML;Montoya R;Rodrigues ES;Kashima S;Sampaio SC;Coluchi N;Leite J;Gresh L;Franco L;Lourenço J;Rico JM;Bispo de Filippis AM;Giovanetti M
登革热病毒（DENV）一直是巴拉圭的一个主要公共卫生问题，自1988年初以来频繁爆发。尽管已经实施了控制措施，但登革热在该国仍然是一个重大的健康威胁，需要持续努力进行预防和控制。为此，我们与亚松森的中央公共卫生实验室合作，进行了便携式全基因组测序和系统动力学分析，以研究巴拉圭在过去几次疫情中传播的登革热病毒株。我们的基因组监测活动揭示了多种登革热病毒血清型的共同传播：登革热病毒 - 1型基因V型、新兴的登革热病毒 - 2型基因III型、BR4 - L2分支以及登革热病毒 - 4型基因II型。结果还强调了巴西作为不同病毒株向美洲其他国家国际传播源头的可能作用，强调了跨境加强监测以早期发现和应对疫情的必要性。这反过来又强调了基因组监测在监测和了解虫媒病毒本地及远距离传播和持续存在方面的关键作用。
Dengue virus (DENV) has been a major public health concern in Paraguay, with frequent outbreaks occurring since early 1988. Although control measures have been implemented, dengue remains a significant health threat in the country, and continued efforts are required for prevention and control. In response to that, in collaboration with the Central Public Health Laboratory in Asunción, we conducted a portable whole-genome sequencing and phylodynamic analysis to investigate DENV viral strains circulating in Paraguay over the past epidemics. Our genomic surveillance activities revealed the co-circulation of multiple DENV serotypes: DENV-1 genotype V, the emerging DENV-2 genotype III, BR4-L2 clade, and DENV-4 genotype II. Results additionally highlight the possible role of Brazil as a source for the international dispersion of different viral strains to other countries in the Americas emphasizing the need for increased surveillance across the borders, for the early detection and response to outbreaks. This, in turn, emphasizes the critical role of genomic surveillance in monitoring and understanding arbovirus transmission and persistence locally and over long distances.
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影响因子：
9.5
作者：
Katoh K;Rozewicki J;Yamada KD
通讯作者：
Yamada KD
DOI：
10.1093/bioinformatics/bty695
发表时间：
2019-03-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Vilsker M;Moosa Y;Nooij S;Fonseca V;Ghysens Y;Dumon K;Pauwels R;Alcantara LC;Vanden Eynden E;Vandamme AM;Deforche K;de Oliveira T
通讯作者：
de Oliveira T
DOI：
10.1038/nrg.2017.88
发表时间：
2018-01
期刊：
Nature reviews. Genetics
影响因子：
--
作者：
Gardy JL;Loman NJ
通讯作者：
Loman NJ
影响因子：
3.8
作者：
Santiago GA;Vergne E;Quiles Y;Cosme J;Vazquez J;Medina JF;Medina F;Colón C;Margolis H;Muñoz-Jordán JL
通讯作者：
Muñoz-Jordán JL
DOI：
10.3390/ijerph191912192
发表时间：
2022-09-26
影响因子：
--
作者：
Gomez, Raquel Elizabeth Gomez;Kim, Jeehyun;Hong, Kwan;Jang, Jin Young;Kisiju, Trishna;Kim, Soojin;Chun, Byung Chul
通讯作者：
Chun, Byung Chul