The DDBJ Japanese Genotype-phenotype Archive for genetic and phenotypic human data.
The DDBJ Japanese Genotype-phenotype Archive for genetic and phenotypic human data.
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DOI：
10.1093/nar/gku1120
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发表时间：
2015-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Nakamura Y
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kodama Y;Mashima J;Kosuge T;Katayama T;Fujisawa T;Kaminuma E;Ogasawara O;Okubo K;Takagi T;Nakamura Y
日本DNA数据库中心（DDBJ中心；http://www.ddbj.nig.ac.jp）维护并提供生物信息的公共存档、检索和分析服务。自 2013 年 10 月以来，DDBJ 中心与我们的合作伙伴日本科学技术振兴机构国家生物科学数据库中心 (NBDC) 合作运营日本基因型-表型档案库 (JGA)。 DDBJ 中心提供 JGA 数据库系统，该系统安全地存储从个人收集的基因型和表型数据，这些个人的同意协议授权数据发布仅用于特定研究用途。 NBDC 制定了共享人类数据的指南和政策，并审查研究人员的数据提交和使用请求。除了 JGA 项目之外，DDBJ 中心还与生命科学数据库中心合作开发用于数据集成和共享的语义 Web 技术。本文介绍了 JGA 项目的概述、DDBJ 数据库的更新以及数据检索、分析和集成服务。
The DNA Data Bank of Japan Center (DDBJ Center; http://www.ddbj.nig.ac.jp) maintains and provides public archival, retrieval and analytical services for biological information. Since October 2013, DDBJ Center has operated the Japanese Genotype-phenotype Archive (JGA) in collaboration with our partner institute, the National Bioscience Database Center (NBDC) of the Japan Science and Technology Agency. DDBJ Center provides the JGA database system which securely stores genotype and phenotype data collected from individuals whose consent agreements authorize data release only for specific research use. NBDC has established guidelines and policies for sharing human-derived data and reviews data submission and usage requests from researchers. In addition to the JGA project, DDBJ Center develops Semantic Web technologies for data integration and sharing in collaboration with the Database Center for Life Science. This paper describes the overview of the JGA project, updates to the DDBJ databases, and services for data retrieval, analysis and integration.
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影响因子：
14.9
作者：
Kodama Y;Shumway M;Leinonen R;International Nucleotide Sequence Database Collaboration
通讯作者：
International Nucleotide Sequence Database Collaboration
影响因子：
5.8
作者：
Holland, R. C. G.;Down, T. A.;Pocock, M.;Prlic, A.;Huen, D.;James, K.;Foisy, S.;Draeger, A.;Yates, A.;Heuer, M.;Schreiber, M. J.
通讯作者：
Schreiber, M. J.
Biopython：用于计算分子生物学和生物信息学的免费 Python 工具。
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp163
发表时间：
2009-06-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Cock PJ;Antao T;Chang JT;Chapman BA;Cox CJ;Dalke A;Friedberg I;Hamelryck T;Kauff F;Wilczynski B;de Hoon MJ
通讯作者：
de Hoon MJ
影响因子：
14.9
作者：
Ogasawara O;Mashima J;Kodama Y;Kaminuma E;Nakamura Y;Okubo K;Takagi T
通讯作者：
Takagi T
影响因子：
14.9
作者：
Pakseresht N;Alako B;Amid C;Cerdeño-Tárraga A;Cleland I;Gibson R;Goodgame N;Gur T;Jang M;Kay S;Leinonen R;Li W;Liu X;Lopez R;McWilliam H;Oisel A;Pallreddy S;Plaister S;Radhakrishnan R;Rivière S;Rossello M;Senf A;Silvester N;Smirnov D;Squizzato S;ten Hoopen P;Toribio AL;Vaughan D;Zalunin V;Cochrane G
通讯作者：
Cochrane G