Assembly information services in the European Nucleotide Archive.
Assembly information services in the European Nucleotide Archive.
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DOI：
10.1093/nar/gkt1082
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发表时间：
2014-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Cochrane G
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Pakseresht N;Alako B;Amid C;Cerdeño-Tárraga A;Cleland I;Gibson R;Goodgame N;Gur T;Jang M;Kay S;Leinonen R;Li W;Liu X;Lopez R;McWilliam H;Oisel A;Pallreddy S;Plaister S;Radhakrishnan R;Rivière S;Rossello M;Senf A;Silvester N;Smirnov D;Squizzato S;ten Hoopen P;Toribio AL;Vaughan D;Zalunin V;Cochrane G
欧洲核苷酸档案（ENA； http://www.ebi.ac.uk/ena）是世界公共域核苷酸序列数据输出的存储库。 ENA内容涵盖了许多数据类型，包括原始读取，汇编数据和功能注释。 ENA在基因组组装提交率，数据量和数据集的复杂性方面面临着巨大的增长。这促使了大会提交服务进行广泛的重新工作，现在我们到达了一项重大工作计划的结束，并且已经在一年中提供了许多增强功能，以提供提交服务的组件。在本文中，我们简要回顾了2013年的ENA内容和增长，描述了我们针对基因组组装信息的快速开发服务，并概述了去年的进一步发展。
The European Nucleotide Archive (ENA; http://www.ebi.ac.uk/ena) is a repository for the world public domain nucleotide sequence data output. ENA content covers a spectrum of data types including raw reads, assembly data and functional annotation. ENA has faced a dramatic growth in genome assembly submission rates, data volumes and complexity of datasets. This has prompted a broad reworking of assembly submission services, for which we now reach the end of a major programme of work and many enhancements have already been made available over the year to components of the submission service. In this article, we briefly review ENA content and growth over 2013, describe our rapidly developing services for genome assembly information and outline further major developments over the last year.
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