ENCODE whole-genome data in the UCSC Genome Browser: update 2012.
ENCODE whole-genome data in the UCSC Genome Browser: update 2012.
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DOI：
10.1093/nar/gkr1012
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发表时间：
2012-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kent WJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Rosenbloom KR;Dreszer TR;Long JC;Malladi VS;Sloan CA;Raney BJ;Cline MS;Karolchik D;Barber GP;Clawson H;Diekhans M;Fujita PA;Goldman M;Gravell RC;Harte RA;Hinrichs AS;Kirkup VM;Kuhn RM;Learned K;Maddren M;Meyer LR;Pohl A;Rhead B;Wong MC;Zweig AS;Haussler D;Kent WJ
DNA元件百科全书（ENCODE）联盟正在进入其生产水平的第五年，致力于生成人类基因组的高质量全基因组功能注释。过去的一年使ENCODE功能元件纲要达到临界质量，27种生物化学测定的多样化现在覆盖了200种不同的人类细胞类型。在过去两年中ENCODE小组一直在研究的小鼠基因组中，已经分析了37种细胞类型。已经完成了2000多个单独的实验，并提交给数据协调中心供公众使用。UCSC将这些数据放在经过质量审查的公共基因组浏览器（genome.ucsc.edu）和早期访问预览浏览器（http：//www.example.com）上。genome-preview.ucsc.edu支持可视化浏览、数据挖掘以及下载原始数据和处理后的数据文件。一个ENCODE门户网站（encodeproject.org）提供关于ENCODE数据集的专门工具和信息。
The Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) Consortium is entering its 5th year of production-level effort generating high-quality whole-genome functional annotations of the human genome. The past year has brought the ENCODE compendium of functional elements to critical mass, with a diverse set of 27 biochemical assays now covering 200 distinct human cell types. Within the mouse genome, which has been under study by ENCODE groups for the past 2 years, 37 cell types have been assayed. Over 2000 individual experiments have been completed and submitted to the Data Coordination Center for public use. UCSC makes this data available on the quality-reviewed public Genome Browser (http://genome.ucsc.edu) and on an early-access Preview Browser (http://genome-preview.ucsc.edu). Visual browsing, data mining and download of raw and processed data files are all supported. An ENCODE portal (http://encodeproject.org) provides specialized tools and information about the ENCODE data sets.
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影响因子：
64.8
作者：
Ernst, Jason;Kheradpour, Pouya;Mikkelsen, Tarjei S.;Shoresh, Noam;Ward, Lucas D.;Epstein, Charles B.;Zhang, Xiaolan;Wang, Li;Issner, Robbyn;Coyne, Michael;Ku, Manching;Durham, Timothy;Kellis, Manolis;Bernstein, Bradley E.
通讯作者：
Bernstein, Bradley E.
影响因子：
9.8
作者：
ENCODE Project Consortium
通讯作者：
ENCODE Project Consortium
影响因子：
12.3
作者：
Li G;Fullwood MJ;Xu H;Mulawadi FH;Velkov S;Vega V;Ariyaratne PN;Mohamed YB;Ooi HS;Tennakoon C;Wei CL;Ruan Y;Sung WK
通讯作者：
Sung WK
影响因子：
14.9
作者：
Benson DA;Karsch-Mizrachi I;Lipman DJ;Ostell J;Sayers EW
通讯作者：
Sayers EW
编码UCSC基因组浏览器中的全基因组数据。
影响因子：
14.9
作者：
Rosenbloom KR;Dreszer TR;Pheasant M;Barber GP;Meyer LR;Pohl A;Raney BJ;Wang T;Hinrichs AS;Zweig AS;Fujita PA;Learned K;Rhead B;Smith KE;Kuhn RM;Karolchik D;Haussler D;Kent WJ
通讯作者：
Kent WJ