Complete genome sequence of a novel Virga-like virus infecting Hevea brasiliensis
Complete genome sequence of a novel Virga-like virus infecting Hevea brasiliensis
复制标题
感染巴西橡胶树的新型virga样病毒的完整基因组序列
DOI：
10.1007/s00705-021-05306-5
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发表时间：
2022-02
影响因子：
2.7
通讯作者：
Xi Huang
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Sixi Chen;Fengjuan Yu;Zhaotong Li;Yonglei Zhang;Hongxing Wang;Jinling Zhai;Xi Huang
本文报道了在橡胶树中发现的一种新病毒的全序列和基因组结构。由于感染的植株无症状，该病毒暂命名为橡胶树潜伏病毒1（RTLV 1）。RTLV 1基因组全长9,422 nt，包含3个开放阅读框，5'端非翻译区（UTR）157 nt，3'端非翻译区316 nt。该复制酶与湖北virga样病毒11号复制酶的氨基酸序列同源性最高，为32.62%，查询覆盖率仅为31%。系统发育分析的基础上的ORF 1的氨基酸序列聚类RTLV 1与未分类的成员的Virgaviridae家庭的一个分支，这是没有密切相关的任何属在这个家庭。
This work reports the complete sequence and genome organization of a novel virus detected in rubber trees (Hevea brasiliensis). Because the infected plants were asymptomatic, this virus was tentatively named rubber tree latent virus 1 (RTLV1). The full genome of RTLV1 is 9,422 nt in length and contains three open reading frames with a 157-nt 5' untranslated region (UTR) and 316-nt 3' UTR. The replicase shares the highest (32.62%) amino acid (aa) sequence identity, at only 31% query coverage, with the replicase of Hubei virga-like virus 11. Phylogenetic analysis based on the aa sequence of ORF1 clustered RTLV1 with unclassified members of the Virgaviridae family in a clade that was not closely related to any genus in this family.
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影响因子：
1.6
作者：
Li Hui-Liang;Guo Dong;Wang Ying;Zhu Jia-Hong;Qu Long;Peng Shi-Qing
通讯作者：
Peng Shi-Qing
影响因子：
--
作者：
J. Van Eck;Patricia Keen;Michelle Tjahjadi
通讯作者：
J. Van Eck;Patricia Keen;Michelle Tjahjadi
影响因子：
5.3
作者：
Martin DP;Murrell B;Golden M;Khoosal A;Muhire B
通讯作者：
Muhire B
DOI：
10.1099/jgv.0.000884
发表时间：
2017-08
期刊：
The Journal of general virology
影响因子：
--
作者：
Adams MJ;Adkins S;Bragard C;Gilmer D;Li D;MacFarlane SA;Wong SM;Melcher U;Ratti C;Ryu KH;Ictv Report Consortium
通讯作者：
Ictv Report Consortium
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--
作者：
H. Zhong;Sivamani Elumalai;Samson Nalapalli;Lee Richbourg;A. Prairie;David Bradley;Shujie Dong;X. Su;W. Gu;Tim Strebe;Liang Shi;Q. Que
通讯作者：
H. Zhong;Sivamani Elumalai;Samson Nalapalli;Lee Richbourg;A. Prairie;David Bradley;Shujie Dong;X. Su;W. Gu;Tim Strebe;Liang Shi;Q. Que