GeneNet in 2005.
GeneNet in 2005.
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DOI：
10.1093/nar/gki077
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发表时间：
2005-01-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kolchanov NA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ananko EA;Podkolodny NL;Stepanenko IL;Podkolodnaya OA;Rasskazov DA;Miginsky DS;Likhoshvai VA;Ratushny AV;Podkolodnaya NN;Kolchanov NA
GeneNet系统是为收集和分析基因和代谢网络、信号转导途径和基本过程的动力学特征而设计的。在过去的两年中，GeneNet的结构得到了很大的改进：(i)当前版本的数据库现在使用ORACLE9i实现；（ii）描述蛋白质复合物结构和单元之间相互作用的能力得到提高；（iii）增加了两个表，其中有动力学常数和对某些反应的更详细的描述；（iv）补充了动力学建模模块。目前SRS发布的GeneNet数据库包含37个基因网络图形图，以及1766个蛋白质，1006个基因，241个小分子和3254个基因网络单元之间的关系，以及552个动力学常数的描述。通过注释1980年的期刊出版物，获得了分布在16个相互关联的表之间的信息。SRS发布的GeneNet数据库，图形查看器和建模部分可在http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/gnw/genenet/上获得。
The GeneNet system is designed for collection and analysis of the data on gene and metabolic networks, signal transduction pathways and kinetic characteristics of elementary processes. In the past 2 years, the GeneNet structure was considerably improved: (i) the current version of the database is now implemented using ORACLE9i; (ii) the capacities to describe the structure of the protein complexes and the interactions between the units are increased; (iii) two tables with kinetic constants and more detailed descriptions of certain reactions were added; and (iv) a module for kinetic modeling was supplemented. The current SRS release of the GeneNet database contains 37 graphical maps of gene networks, as well as descriptions of 1766 proteins, 1006 genes, 241 small molecules and 3254 relationships between gene network units, and 552 kinetic constants. Information distributed between 16 interlinked tables was obtained by annotating 1980 journal publications. SRS release of the GeneNet database, the graphical viewer and the modeling section are available at http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/gnw/genenet/.
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