Systematic analysis of telomere length and somatic alterations in 31 cancer types.
Systematic analysis of telomere length and somatic alterations in 31 cancer types.
复制标题
31种癌症类型的端粒长度和躯体改变的系统分析。
DOI：
10.1038/ng.3781
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发表时间：
2017-03
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Verhaak RG
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Barthel FP;Wei W;Tang M;Martinez-Ledesma E;Hu X;Amin SB;Akdemir KC;Seth S;Song X;Wang Q;Lichtenberg T;Hu J;Zhang J;Zheng S;Verhaak RG
癌细胞通过端粒维持机制在细胞危机中存活。我们报告了18，430个样本的端粒长度，包括31种癌症类型的肿瘤和非肿瘤样本。与正常组织相比，肿瘤端粒较短，与其他癌症相比，肉瘤和胶质瘤中的端粒较长。在6，835例癌症中，73%表达端粒酶逆转录酶（TERT），这与TERT点突变，重排，DNA扩增和转录融合相关，并预测端粒酶活性。TERT启动子甲基化提供了另外的去调节TERT表达机制。5%的病例，大多数是检测不到的TERT，具有ATRX或DAXX改变，表现出端粒延长和端粒重复序列增加。其余22%的肿瘤既不表达TERT，也不具有ATRX/DAXX的改变。在该组中，端粒长度与TP53和RB1突变呈正相关。我们的分析整合了癌症中的端粒酶异常、端粒酶活性和基因组改变与端粒长度。
Cancer cells survive cellular crisis through telomere maintenance mechanisms. We report telomere lengths in 18,430 samples, including tumors and non-neoplastic samples, across 31 cancer types. Tumor telomeres were shorter compared to normal tissues, and longer in sarcomas and gliomas compared to other cancers. Amongst 6,835 cancers, 73% expressed telomerase reverse transcriptase (TERT), which was associated with TERT point mutations, rearrangements, DNA amplifications, and transcript fusions, and predicted telomerase activity. TERT promoter methylation provided an additional deregulatory TERT expression mechanism. Five percent of cases, mostly with undetectable TERT, harbored ATRX or DAXX alterations, demonstrated elongated telomeres and increased telomeric repeat containing RNA (TERRA). The remaining 22% of tumors neither expressed TERT, nor harbored alterations in ATRX/DAXX. In this group, telomere length positively correlated with TP53 and RB1 mutations. Our analysis integrates TERT abnormalities, telomerase activity and genomic alterations with telomere length in cancer.
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影响因子：
16
作者：
Calo, Eliezer;Wysocka, Joanna
通讯作者：
Wysocka, Joanna
DOI：
10.1126/science.1170633
发表时间：
2009-11-13
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
de Lange T
通讯作者：
de Lange T
影响因子：
48
作者：
Katz, Yarden;Wang, Eric T.;Airoldi, Edoardo M.;Burge, Christopher B.
通讯作者：
Burge, Christopher B.
影响因子：
14.9
作者：
Khan A;Zhang X
通讯作者：
Zhang X
胰腺神经内分泌肿瘤中经常改变DAXX/ATRX，MEN1和MTOR途径基因。
DOI：
10.1126/science.1200609
发表时间：
2011-03-04
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Jiao Y;Shi C;Edil BH;de Wilde RF;Klimstra DS;Maitra A;Schulick RD;Tang LH;Wolfgang CL;Choti MA;Velculescu VE;Diaz LA Jr;Vogelstein B;Kinzler KW;Hruban RH;Papadopoulos N
通讯作者：
Papadopoulos N