Mouse genomic variation and its effect on phenotypes and gene regulation.
Mouse genomic variation and its effect on phenotypes and gene regulation.
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DOI：
10.1038/nature10413
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发表时间：
2011-09-14
期刊：
影响因子：
64.8
通讯作者：
Adams, David J.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Keane, Thomas M.;Goodstadt, Leo;Danecek, Petr;White, Michael A.;Wong, Kim;Yalcin, Binnaz;Heger, Andreas;Agam, Avigail;Slater, Guy;Goodson, Martin;Furlotte, Nicholas A.;Eskin, Eleazar;Nellaker, Christoffer;Whitley, Helen;Cleak, James;Janowitz, Deborah;Hernandez-Pliego, Polinka;Edwards, Andrew;Belgard, T. Grant;Oliver, Peter L.;McIntyre, Rebecca E.;Bhomra, Amarjit;Nicod, Jerome;Gan, Xiangchao;Yuan, Wei;van der Weyden, Louise;Steward, Charles A.;Bala, Sendu;Stalker, Jim;Mott, Richard;Durbin, Richard;Jackson, Ian J.;Czechanski, Anne;Guerra-Assuncao, Jose Afonso;Donahue, Leah Rae;Reinholdt, Laura G.;Payseur, Bret A.;Ponting, Chris P.;Birney, Ewan;Flint, Jonathan;Adams, David J.
我们报告了17个实验室小鼠近交系的基因组序列，并确定了比以前已知的几乎多十倍的变异。我们使用这些基因组来探索实验室小鼠的系统发育史，并研究等位基因特异性变异对转录本丰度的功能后果，揭示至少12%的转录本显示出显着的组织特异性表达偏倚。通过鉴定718个数量性状基因座的候选功能变体，我们发现功能变体的分子性质及其相对于基因的位置根据基因座的效应大小而变化。这些序列为关键模式生物功能分析的新时代提供了起点。
We report genome sequences of 17 inbred strains of laboratory mice and identify almost ten times more variants than previously known. We use these genomes to explore the phylogenetic history of the laboratory mouse and to examine the functional consequences of allele-specific variation on transcript abundance, revealing that at least 12% of transcripts show a significant tissue-specific expression bias. By identifying candidate functional variants at 718 quantitative trait loci we show that the molecular nature of functional variants and their position relative to genes vary according to the effect size of the locus. These sequences provide a starting point for a new era in the functional analysis of a key model organism.
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影响因子：
9.8
作者：
Church DM;Goodstadt L;Hillier LW;Zody MC;Goldstein S;She X;Bult CJ;Agarwala R;Cherry JL;DiCuccio M;Hlavina W;Kapustin Y;Meric P;Maglott D;Birtle Z;Marques AC;Graves T;Zhou S;Teague B;Potamousis K;Churas C;Place M;Herschleb J;Runnheim R;Forrest D;Amos-Landgraf J;Schwartz DC;Cheng Z;Lindblad-Toh K;Eichler EE;Ponting CP;Mouse Genome Sequencing Consortium
通讯作者：
Mouse Genome Sequencing Consortium
DOI：
10.1073/pnas.230304397
发表时间：
2000-11-07
影响因子：
11.1
作者：
Mott, R;Talbot, CJ;Flint, J
通讯作者：
Flint, J
影响因子：
1.5
作者：
PAMILO, P;NEI, M;LI, WH
通讯作者：
LI, WH
DOI：
10.1073/pnas.0511189103
发表时间：
2006-03-07
影响因子：
11.1
作者：
Koike, H;Arguello, PA;Gogos, JA
通讯作者：
Gogos, JA
影响因子：
4.4
作者：
Davis, RC;Schadt, EE;Lusis, AJ
通讯作者：
Lusis, AJ